Protein–RNA interactions for Protein: Q14135

VGLL4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, humanhuman

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Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4Q14135 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VGLL4Q14135 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VGLL4Q14135 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VGLL4Q14135 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VGLL4Q14135 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VGLL4Q14135 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VGLL4Q14135 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VGLL4Q14135 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VGLL4Q14135 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VGLL4Q14135 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VGLL4Q14135 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VGLL4Q14135 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VGLL4Q14135 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VGLL4Q14135 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VGLL4Q14135 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VGLL4Q14135 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
VGLL4Q14135 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VGLL4Q14135 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VGLL4Q14135 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VGLL4Q14135 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VGLL4Q14135 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VGLL4Q14135 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VGLL4Q14135 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
VGLL4Q14135 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VGLL4Q14135 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VGLL4Q14135 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VGLL4Q14135 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VGLL4Q14135 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VGLL4Q14135 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VGLL4Q14135 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
VGLL4Q14135 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
VGLL4Q14135 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VGLL4Q14135 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VGLL4Q14135 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VGLL4Q14135 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VGLL4Q14135 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VGLL4Q14135 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VGLL4Q14135 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28■■■□□ 2.07
VGLL4Q14135 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VGLL4Q14135 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VGLL4Q14135 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28■■■□□ 2.07
VGLL4Q14135 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
VGLL4Q14135 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VGLL4Q14135 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
VGLL4Q14135 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VGLL4Q14135 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VGLL4Q14135 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VGLL4Q14135 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
VGLL4Q14135 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VGLL4Q14135 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VGLL4Q14135 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VGLL4Q14135 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VGLL4Q14135 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VGLL4Q14135 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VGLL4Q14135 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VGLL4Q14135 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VGLL4Q14135 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VGLL4Q14135 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VGLL4Q14135 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VGLL4Q14135 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VGLL4Q14135 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VGLL4Q14135 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VGLL4Q14135 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VGLL4Q14135 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
VGLL4Q14135 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
VGLL4Q14135 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
VGLL4Q14135 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
VGLL4Q14135 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
VGLL4Q14135 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VGLL4Q14135 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VGLL4Q14135 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VGLL4Q14135 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VGLL4Q14135 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VGLL4Q14135 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VGLL4Q14135 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VGLL4Q14135 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VGLL4Q14135 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VGLL4Q14135 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VGLL4Q14135 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VGLL4Q14135 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VGLL4Q14135 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VGLL4Q14135 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VGLL4Q14135 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VGLL4Q14135 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VGLL4Q14135 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VGLL4Q14135 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
VGLL4Q14135 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VGLL4Q14135 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VGLL4Q14135 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
VGLL4Q14135 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VGLL4Q14135 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VGLL4Q14135 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VGLL4Q14135 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VGLL4Q14135 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
VGLL4Q14135 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
VGLL4Q14135 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VGLL4Q14135 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VGLL4Q14135 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VGLL4Q14135 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VGLL4Q14135 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
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