Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

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Length 757 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNC3Q14003 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNC3Q14003 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNC3Q14003 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNC3Q14003 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNC3Q14003 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNC3Q14003 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNC3Q14003 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNC3Q14003 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNC3Q14003 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNC3Q14003 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNC3Q14003 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNC3Q14003 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNC3Q14003 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNC3Q14003 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNC3Q14003 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNC3Q14003 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNC3Q14003 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNC3Q14003 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNC3Q14003 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNC3Q14003 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNC3Q14003 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNC3Q14003 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNC3Q14003 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNC3Q14003 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNC3Q14003 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNC3Q14003 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNC3Q14003 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNC3Q14003 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNC3Q14003 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNC3Q14003 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNC3Q14003 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNC3Q14003 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNC3Q14003 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNC3Q14003 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNC3Q14003 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNC3Q14003 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNC3Q14003 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNC3Q14003 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNC3Q14003 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNC3Q14003 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNC3Q14003 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNC3Q14003 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNC3Q14003 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNC3Q14003 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNC3Q14003 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNC3Q14003 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNC3Q14003 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNC3Q14003 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNC3Q14003 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNC3Q14003 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNC3Q14003 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNC3Q14003 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KCNC3Q14003 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNC3Q14003 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNC3Q14003 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNC3Q14003 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNC3Q14003 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNC3Q14003 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNC3Q14003 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNC3Q14003 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNC3Q14003 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNC3Q14003 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNC3Q14003 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNC3Q14003 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNC3Q14003 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNC3Q14003 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNC3Q14003 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNC3Q14003 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNC3Q14003 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNC3Q14003 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNC3Q14003 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNC3Q14003 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNC3Q14003 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNC3Q14003 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNC3Q14003 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNC3Q14003 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNC3Q14003 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNC3Q14003 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNC3Q14003 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNC3Q14003 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNC3Q14003 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNC3Q14003 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNC3Q14003 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNC3Q14003 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNC3Q14003 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNC3Q14003 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNC3Q14003 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNC3Q14003 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNC3Q14003 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNC3Q14003 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNC3Q14003 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNC3Q14003 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNC3Q14003 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNC3Q14003 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNC3Q14003 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNC3Q14003 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNC3Q14003 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNC3Q14003 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNC3Q14003 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
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