Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PKP1Q13835 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PKP1Q13835 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PKP1Q13835 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PKP1Q13835 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PKP1Q13835 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PKP1Q13835 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PKP1Q13835 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PKP1Q13835 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PKP1Q13835 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PKP1Q13835 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PKP1Q13835 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PKP1Q13835 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PKP1Q13835 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PKP1Q13835 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PKP1Q13835 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PKP1Q13835 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PKP1Q13835 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PKP1Q13835 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PKP1Q13835 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PKP1Q13835 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PKP1Q13835 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PKP1Q13835 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PKP1Q13835 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PKP1Q13835 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PKP1Q13835 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PKP1Q13835 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PKP1Q13835 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PKP1Q13835 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PKP1Q13835 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PKP1Q13835 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PKP1Q13835 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PKP1Q13835 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PKP1Q13835 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PKP1Q13835 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PKP1Q13835 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PKP1Q13835 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PKP1Q13835 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PKP1Q13835 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PKP1Q13835 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PKP1Q13835 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PKP1Q13835 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PKP1Q13835 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PKP1Q13835 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PKP1Q13835 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PKP1Q13835 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PKP1Q13835 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PKP1Q13835 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PKP1Q13835 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PKP1Q13835 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PKP1Q13835 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PKP1Q13835 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PKP1Q13835 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PKP1Q13835 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PKP1Q13835 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PKP1Q13835 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PKP1Q13835 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PKP1Q13835 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PKP1Q13835 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PKP1Q13835 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PKP1Q13835 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PKP1Q13835 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PKP1Q13835 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PKP1Q13835 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PKP1Q13835 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PKP1Q13835 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PKP1Q13835 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PKP1Q13835 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PKP1Q13835 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PKP1Q13835 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PKP1Q13835 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PKP1Q13835 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PKP1Q13835 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PKP1Q13835 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PKP1Q13835 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PKP1Q13835 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PKP1Q13835 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PKP1Q13835 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PKP1Q13835 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PKP1Q13835 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PKP1Q13835 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PKP1Q13835 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PKP1Q13835 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PKP1Q13835 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PKP1Q13835 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PKP1Q13835 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PKP1Q13835 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKP1Q13835 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKP1Q13835 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKP1Q13835 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKP1Q13835 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKP1Q13835 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKP1Q13835 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKP1Q13835 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKP1Q13835 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKP1Q13835 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKP1Q13835 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKP1Q13835 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PKP1Q13835 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PKP1Q13835 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
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