Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1orf61Q13536 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1orf61Q13536 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1orf61Q13536 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1orf61Q13536 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1orf61Q13536 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf61Q13536 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf61Q13536 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf61Q13536 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf61Q13536 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf61Q13536 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf61Q13536 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf61Q13536 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf61Q13536 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf61Q13536 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf61Q13536 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf61Q13536 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf61Q13536 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1orf61Q13536 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1orf61Q13536 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1orf61Q13536 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1orf61Q13536 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1orf61Q13536 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf61Q13536 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf61Q13536 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf61Q13536 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf61Q13536 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf61Q13536 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf61Q13536 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf61Q13536 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf61Q13536 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf61Q13536 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf61Q13536 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1orf61Q13536 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1orf61Q13536 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1orf61Q13536 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1orf61Q13536 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1orf61Q13536 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
C1orf61Q13536 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1orf61Q13536 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1orf61Q13536 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1orf61Q13536 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
C1orf61Q13536 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf61Q13536 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf61Q13536 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf61Q13536 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf61Q13536 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf61Q13536 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf61Q13536 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf61Q13536 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf61Q13536 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf61Q13536 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf61Q13536 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf61Q13536 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf61Q13536 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf61Q13536 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf61Q13536 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf61Q13536 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf61Q13536 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf61Q13536 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf61Q13536 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf61Q13536 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf61Q13536 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf61Q13536 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf61Q13536 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf61Q13536 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf61Q13536 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf61Q13536 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf61Q13536 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf61Q13536 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf61Q13536 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf61Q13536 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf61Q13536 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf61Q13536 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf61Q13536 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf61Q13536 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf61Q13536 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf61Q13536 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf61Q13536 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf61Q13536 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf61Q13536 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf61Q13536 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf61Q13536 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf61Q13536 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf61Q13536 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf61Q13536 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf61Q13536 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf61Q13536 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf61Q13536 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf61Q13536 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf61Q13536 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf61Q13536 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf61Q13536 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf61Q13536 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1orf61Q13536 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1orf61Q13536 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1orf61Q13536 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1orf61Q13536 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1orf61Q13536 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1orf61Q13536 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
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