Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTK7Q13308 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTK7Q13308 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTK7Q13308 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTK7Q13308 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PTK7Q13308 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PTK7Q13308 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTK7Q13308 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTK7Q13308 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTK7Q13308 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTK7Q13308 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTK7Q13308 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTK7Q13308 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTK7Q13308 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTK7Q13308 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTK7Q13308 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTK7Q13308 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTK7Q13308 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTK7Q13308 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTK7Q13308 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTK7Q13308 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTK7Q13308 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTK7Q13308 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTK7Q13308 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTK7Q13308 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTK7Q13308 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTK7Q13308 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PTK7Q13308 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTK7Q13308 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTK7Q13308 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTK7Q13308 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTK7Q13308 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTK7Q13308 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTK7Q13308 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTK7Q13308 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTK7Q13308 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTK7Q13308 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTK7Q13308 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTK7Q13308 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTK7Q13308 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTK7Q13308 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTK7Q13308 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTK7Q13308 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTK7Q13308 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PTK7Q13308 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTK7Q13308 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTK7Q13308 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTK7Q13308 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTK7Q13308 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTK7Q13308 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTK7Q13308 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTK7Q13308 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTK7Q13308 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTK7Q13308 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTK7Q13308 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTK7Q13308 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTK7Q13308 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTK7Q13308 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PTK7Q13308 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTK7Q13308 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTK7Q13308 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTK7Q13308 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTK7Q13308 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTK7Q13308 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTK7Q13308 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTK7Q13308 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTK7Q13308 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTK7Q13308 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTK7Q13308 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTK7Q13308 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTK7Q13308 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTK7Q13308 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTK7Q13308 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTK7Q13308 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTK7Q13308 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTK7Q13308 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTK7Q13308 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTK7Q13308 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTK7Q13308 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PTK7Q13308 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTK7Q13308 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTK7Q13308 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTK7Q13308 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTK7Q13308 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTK7Q13308 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTK7Q13308 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTK7Q13308 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTK7Q13308 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTK7Q13308 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTK7Q13308 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTK7Q13308 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PTK7Q13308 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTK7Q13308 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTK7Q13308 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTK7Q13308 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTK7Q13308 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTK7Q13308 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTK7Q13308 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTK7Q13308 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTK7Q13308 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
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