Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ECH1Q13011 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ECH1Q13011 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ECH1Q13011 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ECH1Q13011 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ECH1Q13011 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ECH1Q13011 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ECH1Q13011 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ECH1Q13011 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ECH1Q13011 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ECH1Q13011 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ECH1Q13011 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ECH1Q13011 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ECH1Q13011 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ECH1Q13011 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ECH1Q13011 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ECH1Q13011 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ECH1Q13011 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ECH1Q13011 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ECH1Q13011 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ECH1Q13011 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ECH1Q13011 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ECH1Q13011 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ECH1Q13011 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ECH1Q13011 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ECH1Q13011 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ECH1Q13011 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ECH1Q13011 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ECH1Q13011 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ECH1Q13011 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ECH1Q13011 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ECH1Q13011 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ECH1Q13011 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ECH1Q13011 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ECH1Q13011 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ECH1Q13011 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ECH1Q13011 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ECH1Q13011 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ECH1Q13011 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ECH1Q13011 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ECH1Q13011 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ECH1Q13011 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ECH1Q13011 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ECH1Q13011 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ECH1Q13011 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ECH1Q13011 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ECH1Q13011 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ECH1Q13011 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ECH1Q13011 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ECH1Q13011 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ECH1Q13011 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ECH1Q13011 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ECH1Q13011 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ECH1Q13011 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ECH1Q13011 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ECH1Q13011 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ECH1Q13011 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ECH1Q13011 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ECH1Q13011 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ECH1Q13011 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ECH1Q13011 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ECH1Q13011 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ECH1Q13011 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ECH1Q13011 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ECH1Q13011 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ECH1Q13011 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ECH1Q13011 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ECH1Q13011 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ECH1Q13011 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ECH1Q13011 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ECH1Q13011 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ECH1Q13011 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ECH1Q13011 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ECH1Q13011 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ECH1Q13011 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ECH1Q13011 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ECH1Q13011 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ECH1Q13011 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ECH1Q13011 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ECH1Q13011 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ECH1Q13011 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ECH1Q13011 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ECH1Q13011 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ECH1Q13011 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ECH1Q13011 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ECH1Q13011 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ECH1Q13011 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ECH1Q13011 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ECH1Q13011 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ECH1Q13011 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ECH1Q13011 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ECH1Q13011 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ECH1Q13011 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ECH1Q13011 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ECH1Q13011 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ECH1Q13011 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ECH1Q13011 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ECH1Q13011 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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