Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIK2Q13002 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIK2Q13002 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIK2Q13002 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIK2Q13002 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIK2Q13002 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIK2Q13002 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIK2Q13002 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIK2Q13002 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIK2Q13002 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIK2Q13002 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIK2Q13002 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIK2Q13002 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIK2Q13002 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIK2Q13002 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIK2Q13002 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIK2Q13002 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIK2Q13002 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIK2Q13002 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIK2Q13002 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIK2Q13002 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIK2Q13002 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIK2Q13002 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIK2Q13002 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIK2Q13002 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIK2Q13002 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIK2Q13002 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIK2Q13002 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIK2Q13002 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIK2Q13002 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIK2Q13002 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIK2Q13002 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIK2Q13002 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIK2Q13002 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIK2Q13002 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIK2Q13002 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIK2Q13002 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
GRIK2Q13002 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIK2Q13002 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIK2Q13002 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIK2Q13002 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIK2Q13002 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIK2Q13002 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIK2Q13002 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIK2Q13002 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIK2Q13002 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIK2Q13002 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIK2Q13002 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIK2Q13002 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIK2Q13002 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIK2Q13002 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIK2Q13002 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIK2Q13002 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIK2Q13002 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIK2Q13002 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIK2Q13002 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIK2Q13002 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIK2Q13002 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIK2Q13002 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIK2Q13002 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIK2Q13002 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIK2Q13002 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIK2Q13002 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIK2Q13002 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIK2Q13002 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIK2Q13002 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIK2Q13002 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIK2Q13002 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIK2Q13002 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIK2Q13002 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIK2Q13002 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIK2Q13002 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIK2Q13002 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIK2Q13002 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIK2Q13002 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIK2Q13002 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIK2Q13002 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIK2Q13002 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIK2Q13002 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIK2Q13002 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
GRIK2Q13002 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIK2Q13002 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIK2Q13002 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIK2Q13002 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIK2Q13002 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIK2Q13002 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIK2Q13002 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIK2Q13002 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIK2Q13002 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIK2Q13002 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIK2Q13002 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIK2Q13002 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIK2Q13002 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIK2Q13002 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIK2Q13002 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIK2Q13002 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIK2Q13002 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIK2Q13002 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIK2Q13002 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIK2Q13002 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms