Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BNIP1Q12981 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BNIP1Q12981 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BNIP1Q12981 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BNIP1Q12981 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BNIP1Q12981 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BNIP1Q12981 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BNIP1Q12981 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BNIP1Q12981 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BNIP1Q12981 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
BNIP1Q12981 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BNIP1Q12981 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BNIP1Q12981 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BNIP1Q12981 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BNIP1Q12981 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
BNIP1Q12981 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BNIP1Q12981 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BNIP1Q12981 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BNIP1Q12981 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BNIP1Q12981 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BNIP1Q12981 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BNIP1Q12981 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BNIP1Q12981 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BNIP1Q12981 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BNIP1Q12981 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BNIP1Q12981 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BNIP1Q12981 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BNIP1Q12981 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BNIP1Q12981 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BNIP1Q12981 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BNIP1Q12981 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BNIP1Q12981 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BNIP1Q12981 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BNIP1Q12981 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BNIP1Q12981 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BNIP1Q12981 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BNIP1Q12981 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BNIP1Q12981 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BNIP1Q12981 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BNIP1Q12981 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BNIP1Q12981 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BNIP1Q12981 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BNIP1Q12981 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BNIP1Q12981 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BNIP1Q12981 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BNIP1Q12981 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BNIP1Q12981 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BNIP1Q12981 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BNIP1Q12981 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BNIP1Q12981 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BNIP1Q12981 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BNIP1Q12981 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BNIP1Q12981 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BNIP1Q12981 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BNIP1Q12981 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BNIP1Q12981 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BNIP1Q12981 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BNIP1Q12981 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BNIP1Q12981 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BNIP1Q12981 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BNIP1Q12981 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BNIP1Q12981 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BNIP1Q12981 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BNIP1Q12981 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BNIP1Q12981 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BNIP1Q12981 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BNIP1Q12981 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BNIP1Q12981 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BNIP1Q12981 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BNIP1Q12981 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BNIP1Q12981 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BNIP1Q12981 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BNIP1Q12981 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BNIP1Q12981 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BNIP1Q12981 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BNIP1Q12981 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BNIP1Q12981 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BNIP1Q12981 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BNIP1Q12981 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BNIP1Q12981 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BNIP1Q12981 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BNIP1Q12981 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BNIP1Q12981 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BNIP1Q12981 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BNIP1Q12981 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BNIP1Q12981 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BNIP1Q12981 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BNIP1Q12981 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BNIP1Q12981 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BNIP1Q12981 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BNIP1Q12981 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BNIP1Q12981 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
BNIP1Q12981 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BNIP1Q12981 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BNIP1Q12981 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BNIP1Q12981 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BNIP1Q12981 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BNIP1Q12981 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BNIP1Q12981 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BNIP1Q12981 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
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