Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXF2Q12947 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXF2Q12947 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXF2Q12947 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXF2Q12947 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXF2Q12947 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXF2Q12947 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXF2Q12947 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXF2Q12947 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXF2Q12947 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXF2Q12947 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXF2Q12947 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXF2Q12947 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXF2Q12947 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXF2Q12947 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXF2Q12947 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXF2Q12947 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXF2Q12947 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXF2Q12947 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXF2Q12947 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXF2Q12947 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXF2Q12947 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXF2Q12947 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXF2Q12947 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXF2Q12947 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXF2Q12947 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXF2Q12947 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXF2Q12947 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXF2Q12947 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXF2Q12947 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXF2Q12947 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXF2Q12947 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXF2Q12947 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXF2Q12947 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXF2Q12947 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXF2Q12947 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXF2Q12947 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXF2Q12947 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXF2Q12947 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXF2Q12947 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXF2Q12947 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXF2Q12947 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXF2Q12947 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXF2Q12947 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXF2Q12947 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXF2Q12947 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXF2Q12947 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXF2Q12947 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
FOXF2Q12947 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXF2Q12947 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXF2Q12947 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXF2Q12947 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXF2Q12947 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXF2Q12947 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXF2Q12947 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXF2Q12947 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXF2Q12947 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXF2Q12947 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXF2Q12947 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXF2Q12947 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXF2Q12947 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXF2Q12947 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXF2Q12947 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOXF2Q12947 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOXF2Q12947 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOXF2Q12947 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOXF2Q12947 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOXF2Q12947 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXF2Q12947 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXF2Q12947 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXF2Q12947 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXF2Q12947 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXF2Q12947 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXF2Q12947 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXF2Q12947 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXF2Q12947 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXF2Q12947 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXF2Q12947 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXF2Q12947 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXF2Q12947 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXF2Q12947 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXF2Q12947 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXF2Q12947 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXF2Q12947 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXF2Q12947 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXF2Q12947 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXF2Q12947 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXF2Q12947 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXF2Q12947 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXF2Q12947 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXF2Q12947 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXF2Q12947 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXF2Q12947 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXF2Q12947 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXF2Q12947 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXF2Q12947 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXF2Q12947 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXF2Q12947 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXF2Q12947 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXF2Q12947 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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