Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTN1Q12860 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTN1Q12860 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTN1Q12860 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTN1Q12860 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTN1Q12860 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTN1Q12860 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTN1Q12860 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTN1Q12860 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTN1Q12860 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTN1Q12860 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTN1Q12860 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTN1Q12860 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTN1Q12860 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTN1Q12860 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTN1Q12860 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CNTN1Q12860 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNTN1Q12860 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTN1Q12860 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTN1Q12860 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTN1Q12860 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTN1Q12860 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTN1Q12860 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTN1Q12860 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTN1Q12860 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTN1Q12860 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTN1Q12860 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTN1Q12860 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTN1Q12860 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTN1Q12860 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTN1Q12860 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTN1Q12860 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTN1Q12860 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTN1Q12860 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTN1Q12860 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTN1Q12860 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTN1Q12860 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTN1Q12860 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTN1Q12860 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTN1Q12860 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTN1Q12860 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTN1Q12860 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTN1Q12860 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTN1Q12860 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTN1Q12860 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTN1Q12860 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTN1Q12860 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTN1Q12860 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTN1Q12860 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTN1Q12860 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTN1Q12860 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTN1Q12860 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTN1Q12860 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTN1Q12860 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTN1Q12860 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTN1Q12860 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTN1Q12860 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTN1Q12860 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTN1Q12860 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNTN1Q12860 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNTN1Q12860 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNTN1Q12860 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNTN1Q12860 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNTN1Q12860 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNTN1Q12860 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNTN1Q12860 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNTN1Q12860 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNTN1Q12860 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNTN1Q12860 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNTN1Q12860 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNTN1Q12860 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNTN1Q12860 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNTN1Q12860 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNTN1Q12860 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNTN1Q12860 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNTN1Q12860 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CNTN1Q12860 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTN1Q12860 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTN1Q12860 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTN1Q12860 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTN1Q12860 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTN1Q12860 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTN1Q12860 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTN1Q12860 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTN1Q12860 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTN1Q12860 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTN1Q12860 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTN1Q12860 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTN1Q12860 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNTN1Q12860 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNTN1Q12860 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNTN1Q12860 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNTN1Q12860 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNTN1Q12860 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNTN1Q12860 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNTN1Q12860 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNTN1Q12860 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNTN1Q12860 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CNTN1Q12860 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNTN1Q12860 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
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