Protein–RNA interactions for Protein: Q12849

GRSF1, G-rich sequence factor 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRSF1Q12849 ELOC-202ENST00000518127 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.888e-7■■□□□ 13.7
GRSF1Q12849 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.338e-7■■□□□ 13.7
GRSF1Q12849 RPA1-202ENST00000570451 630 ntTSL 322.45■■□□□ 1.182e-6■■□□□ 13.7
GRSF1Q12849 RPA1-203ENST00000571058 577 ntTSL 418.29■□□□□ 0.522e-6■■□□□ 13.7
GRSF1Q12849 COL27A1-207ENST00000494090 5329 ntTSL 1 (best)18.87■□□□□ 0.613e-8■■□□□ 13.7
GRSF1Q12849 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.393e-8■■□□□ 13.7
GRSF1Q12849 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.115e-9■■□□□ 13.6
GRSF1Q12849 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.21e-8■■□□□ 13.6
GRSF1Q12849 SPECC1L-201ENST00000314328 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.611e-8■■□□□ 13.6
GRSF1Q12849 SPECC1L-204ENST00000437398 6674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.611e-8■■□□□ 13.6
GRSF1Q12849 FBL-206ENST00000597224 732 ntTSL 38.83□□□□□ -14e-9■■□□□ 13.6
GRSF1Q12849 TNK2-220ENST00000486523 300 ntTSL 321.79■■□□□ 1.083e-7■■□□□ 13.6
GRSF1Q12849 TNK2-207ENST00000427576 541 ntTSL 321.06■□□□□ 0.963e-7■■□□□ 13.6
GRSF1Q12849 TNK2-212ENST00000439230 2331 ntTSL 1 (best)17.73■□□□□ 0.433e-7■■□□□ 13.6
GRSF1Q12849 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.213e-7■■□□□ 13.6
GRSF1Q12849 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.365e-18■■□□□ 13.6
GRSF1Q12849 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.095e-18■■□□□ 13.6
GRSF1Q12849 ILF3-220ENST00000590869 531 ntTSL 513.81□□□□□ -0.25e-18■■□□□ 13.6
GRSF1Q12849 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.335e-18■■□□□ 13.6
GRSF1Q12849 ILF3-219ENST00000590261 3219 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.385e-18■■□□□ 13.6
GRSF1Q12849 ILF3-202ENST00000407004 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.55e-18■■□□□ 13.6
GRSF1Q12849 ILF3-222ENST00000592763 3866 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.715e-18■■□□□ 13.6
GRSF1Q12849 ILF3-208ENST00000587928 4230 ntTSL 210.59□□□□□ -0.715e-18■■□□□ 13.6
GRSF1Q12849 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.061e-15■■□□□ 13.5
GRSF1Q12849 PICALM-201ENST00000356360 1958 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.093e-8■■□□□ 13.5
GRSF1Q12849 LONP1-206ENST00000587552 2816 ntTSL 215.19■□□□□ 0.022e-15■■□□□ 13.5
GRSF1Q12849 FAM117A-206ENST00000506156 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 327.43■■□□□ 1.983e-9■■□□□ 13.5
GRSF1Q12849 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.663e-9■■□□□ 13.5
GRSF1Q12849 FAM117A-210ENST00000514018 1128 ntTSL 518.53■□□□□ 0.563e-9■■□□□ 13.5
GRSF1Q12849 FAM117A-205ENST00000505159 739 ntTSL 315.66■□□□□ 0.13e-9■■□□□ 13.5
GRSF1Q12849 FAM117A-209ENST00000513602 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.343e-9■■□□□ 13.5
GRSF1Q12849 FAM117A-204ENST00000503855 582 ntTSL 312.37□□□□□ -0.433e-9■■□□□ 13.5
GRSF1Q12849 FAM117A-207ENST00000509347 572 ntTSL 410.16□□□□□ -0.783e-9■■□□□ 13.5
GRSF1Q12849 FAM117A-203ENST00000503720 528 ntTSL 48.91□□□□□ -0.983e-9■■□□□ 13.5
GRSF1Q12849 AL121845.3-202ENST00000632538 872 ntAPPRIS P1 TSL 321.81■■□□□ 1.084e-6■■□□□ 13.5
GRSF1Q12849 PQLC1-210ENST00000589452 704 ntTSL 530.59■■■□□ 2.492e-6■■□□□ 13.4
GRSF1Q12849 PQLC1-214ENST00000593030 764 ntTSL 527.44■■□□□ 1.982e-6■■□□□ 13.4
GRSF1Q12849 PQLC1-213ENST00000591964 856 ntTSL 327.01■■□□□ 1.912e-6■■□□□ 13.4
GRSF1Q12849 PQLC1-208ENST00000494607 666 ntTSL 316.77■□□□□ 0.282e-6■■□□□ 13.4
GRSF1Q12849 PQLC1-207ENST00000478144 409 ntTSL 312.62□□□□□ -0.392e-6■■□□□ 13.4
GRSF1Q12849 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.272e-12■■□□□ 13.4
GRSF1Q12849 HK2-202ENST00000409174 5278 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.662e-12■■□□□ 13.4
GRSF1Q12849 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.628e-11■■□□□ 13.4
GRSF1Q12849 PRRC2A-211ENST00000484787 756 ntTSL 214.08□□□□□ -0.168e-11■■□□□ 13.4
GRSF1Q12849 PRRC2A-202ENST00000376033 6893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.48e-11■■□□□ 13.4
GRSF1Q12849 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.786e-10■■□□□ 13.4
GRSF1Q12849 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.66e-10■■□□□ 13.4
GRSF1Q12849 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.416e-10■■□□□ 13.4
GRSF1Q12849 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.186e-10■■□□□ 13.4
GRSF1Q12849 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.122e-26■■□□□ 13.4
GRSF1Q12849 SLC7A5-203ENST00000565644 3983 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.72e-26■■□□□ 13.4
GRSF1Q12849 FUS-212ENST00000569760 639 ntTSL 224.85■■□□□ 1.577e-10■■□□□ 13.4
GRSF1Q12849 DYNC1H1-201ENST00000360184 14333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.731e-8■■□□□ 13.4
GRSF1Q12849 RPA1-201ENST00000254719 4340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -11e-6■■□□□ 13.4
GRSF1Q12849 BAP1-204ENST00000469613 1654 ntTSL 1 (best)17.58■□□□□ 0.41e-6■■□□□ 13.4
GRSF1Q12849 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.251e-6■■□□□ 13.4
GRSF1Q12849 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC13.95□□□□□ -0.181e-6■■□□□ 13.4
GRSF1Q12849 BAP1-201ENST00000296288 3434 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.721e-6■■□□□ 13.4
GRSF1Q12849 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.935e-13■■□□□ 13.3
GRSF1Q12849 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.425e-13■■□□□ 13.3
GRSF1Q12849 PPP2CB-207ENST00000520500 603 ntTSL 46.64□□□□□ -1.355e-13■■□□□ 13.3
GRSF1Q12849 PPP2CB-202ENST00000518243 577 ntTSL 34.37□□□□□ -1.715e-13■■□□□ 13.3
GRSF1Q12849 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.697e-7■■□□□ 13.3
GRSF1Q12849 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.667e-7■■□□□ 13.3
GRSF1Q12849 MRPL3-210ENST00000512877 659 ntTSL 319.12■□□□□ 0.657e-7■■□□□ 13.3
GRSF1Q12849 MRPL3-209ENST00000511168 1377 ntTSL 218.25■□□□□ 0.517e-7■■□□□ 13.3
GRSF1Q12849 ERH-201ENST00000216520 668 ntTSL 316.03■□□□□ 0.161e-12■■□□□ 13.3
GRSF1Q12849 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.11e-12■■□□□ 13.3
GRSF1Q12849 MRPL3-208ENST00000510923 813 ntTSL 214.95□□□□□ -0.027e-7■■□□□ 13.3
GRSF1Q12849 MRPL3-205ENST00000507669 848 ntTSL 314.95□□□□□ -0.027e-7■■□□□ 13.3
GRSF1Q12849 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.199e-8■■□□□ 13.3
GRSF1Q12849 CELF1-204ENST00000395290 7666 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.449e-8■■□□□ 13.3
GRSF1Q12849 MRPL3-207ENST00000510154 532 ntTSL 411.06□□□□□ -0.647e-7■■□□□ 13.3
GRSF1Q12849 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.062e-6■■□□□ 13.2
GRSF1Q12849 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.022e-6■■□□□ 13.2
GRSF1Q12849 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.062e-6■■□□□ 13.2
GRSF1Q12849 MROH1-205ENST00000527552 5832 ntTSL 1 (best)12.69□□□□□ -0.382e-6■■□□□ 13.2
GRSF1Q12849 MROH1-211ENST00000544576 3673 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.552e-6■■□□□ 13.2
GRSF1Q12849 MROH1-208ENST00000532255 3905 ntTSL 211.38□□□□□ -0.592e-6■■□□□ 13.2
GRSF1Q12849 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.972e-9■■□□□ 13.2
GRSF1Q12849 JPT2-213ENST00000569256 911 ntTSL 1 (best)18.88■□□□□ 0.612e-9■■□□□ 13.2
GRSF1Q12849 JPT2-209ENST00000566742 593 ntTSL 417.58■□□□□ 0.42e-9■■□□□ 13.2
GRSF1Q12849 JPT2-202ENST00000382710 962 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.42e-9■■□□□ 13.2
GRSF1Q12849 JPT2-206ENST00000562684 3185 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.472e-9■■□□□ 13.2
GRSF1Q12849 JPT2-201ENST00000248098 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.572e-9■■□□□ 13.2
GRSF1Q12849 JPT2-205ENST00000562569 458 ntTSL 37.35□□□□□ -1.232e-9■■□□□ 13.2
GRSF1Q12849 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.631e-9■■□□□ 13.1
GRSF1Q12849 ERO1A-207ENST00000556223 567 ntTSL 417.2■□□□□ 0.345e-22■■□□□ 13.1
GRSF1Q12849 ERO1A-204ENST00000554251 555 ntTSL 517.2■□□□□ 0.345e-22■■□□□ 13.1
GRSF1Q12849 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.682e-6■■□□□ 13.1
GRSF1Q12849 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.632e-6■■□□□ 13.1
GRSF1Q12849 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.22e-6■■□□□ 13.1
GRSF1Q12849 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.032e-6■■□□□ 13.1
GRSF1Q12849 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.262e-6■■□□□ 13.1
GRSF1Q12849 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.28e-8■■□□□ 13
GRSF1Q12849 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.188e-8■■□□□ 13
GRSF1Q12849 TNKS1BP1-204ENST00000528882 4336 ntTSL 515.42■□□□□ 0.068e-8■■□□□ 13
GRSF1Q12849 RPA1-207ENST00000574049 3849 ntTSL 57.28□□□□□ -1.249e-7■■□□□ 13
GRSF1Q12849 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.133e-10■■□□□ 13
GRSF1Q12849 PLEKHB1-205ENST00000426191 2022 ntTSL 219.67■□□□□ 0.743e-10■■□□□ 13
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