Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB40BQ12829 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB40BQ12829 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB40BQ12829 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB40BQ12829 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB40BQ12829 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB40BQ12829 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB40BQ12829 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB40BQ12829 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB40BQ12829 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB40BQ12829 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB40BQ12829 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB40BQ12829 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB40BQ12829 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB40BQ12829 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB40BQ12829 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB40BQ12829 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB40BQ12829 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB40BQ12829 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB40BQ12829 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB40BQ12829 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB40BQ12829 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB40BQ12829 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB40BQ12829 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB40BQ12829 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB40BQ12829 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB40BQ12829 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB40BQ12829 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB40BQ12829 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB40BQ12829 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB40BQ12829 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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RAB40BQ12829 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB40BQ12829 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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RAB40BQ12829 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB40BQ12829 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB40BQ12829 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB40BQ12829 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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RAB40BQ12829 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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RAB40BQ12829 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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RAB40BQ12829 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB40BQ12829 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB40BQ12829 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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RAB40BQ12829 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB40BQ12829 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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RAB40BQ12829 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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RAB40BQ12829 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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RAB40BQ12829 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB40BQ12829 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB40BQ12829 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB40BQ12829 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB40BQ12829 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB40BQ12829 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB40BQ12829 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB40BQ12829 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB40BQ12829 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB40BQ12829 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB40BQ12829 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB40BQ12829 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB40BQ12829 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB40BQ12829 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB40BQ12829 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB40BQ12829 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB40BQ12829 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB40BQ12829 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB40BQ12829 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB40BQ12829 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB40BQ12829 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB40BQ12829 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB40BQ12829 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB40BQ12829 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB40BQ12829 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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