Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNMA1Q12791 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNMA1Q12791 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNMA1Q12791 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNMA1Q12791 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNMA1Q12791 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNMA1Q12791 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNMA1Q12791 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNMA1Q12791 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNMA1Q12791 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNMA1Q12791 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNMA1Q12791 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNMA1Q12791 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNMA1Q12791 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNMA1Q12791 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNMA1Q12791 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNMA1Q12791 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNMA1Q12791 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNMA1Q12791 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNMA1Q12791 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNMA1Q12791 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNMA1Q12791 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNMA1Q12791 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNMA1Q12791 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNMA1Q12791 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNMA1Q12791 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNMA1Q12791 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNMA1Q12791 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNMA1Q12791 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNMA1Q12791 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNMA1Q12791 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNMA1Q12791 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNMA1Q12791 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNMA1Q12791 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNMA1Q12791 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
KCNMA1Q12791 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KCNMA1Q12791 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNMA1Q12791 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNMA1Q12791 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNMA1Q12791 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNMA1Q12791 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNMA1Q12791 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNMA1Q12791 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNMA1Q12791 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNMA1Q12791 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNMA1Q12791 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNMA1Q12791 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNMA1Q12791 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNMA1Q12791 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNMA1Q12791 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNMA1Q12791 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNMA1Q12791 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNMA1Q12791 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNMA1Q12791 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNMA1Q12791 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNMA1Q12791 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNMA1Q12791 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNMA1Q12791 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNMA1Q12791 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNMA1Q12791 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNMA1Q12791 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNMA1Q12791 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNMA1Q12791 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNMA1Q12791 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNMA1Q12791 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNMA1Q12791 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNMA1Q12791 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNMA1Q12791 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNMA1Q12791 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
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KCNMA1Q12791 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNMA1Q12791 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNMA1Q12791 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNMA1Q12791 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNMA1Q12791 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNMA1Q12791 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNMA1Q12791 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KCNMA1Q12791 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KCNMA1Q12791 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNMA1Q12791 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNMA1Q12791 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNMA1Q12791 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNMA1Q12791 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNMA1Q12791 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNMA1Q12791 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNMA1Q12791 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNMA1Q12791 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNMA1Q12791 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNMA1Q12791 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNMA1Q12791 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNMA1Q12791 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNMA1Q12791 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNMA1Q12791 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNMA1Q12791 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNMA1Q12791 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNMA1Q12791 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNMA1Q12791 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNMA1Q12791 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
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