Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
ARHGEF5Q12774 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
ARHGEF5Q12774 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ARHGEF5Q12774 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
ARHGEF5Q12774 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ARHGEF5Q12774 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ARHGEF5Q12774 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
ARHGEF5Q12774 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ARHGEF5Q12774 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ARHGEF5Q12774 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
ARHGEF5Q12774 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
ARHGEF5Q12774 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
ARHGEF5Q12774 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ARHGEF5Q12774 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ARHGEF5Q12774 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ARHGEF5Q12774 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ARHGEF5Q12774 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
ARHGEF5Q12774 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.36
ARHGEF5Q12774 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
ARHGEF5Q12774 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
ARHGEF5Q12774 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
ARHGEF5Q12774 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ARHGEF5Q12774 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ARHGEF5Q12774 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ARHGEF5Q12774 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ARHGEF5Q12774 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
ARHGEF5Q12774 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
ARHGEF5Q12774 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
ARHGEF5Q12774 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
ARHGEF5Q12774 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ARHGEF5Q12774 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ARHGEF5Q12774 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
ARHGEF5Q12774 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
ARHGEF5Q12774 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
ARHGEF5Q12774 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
ARHGEF5Q12774 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
ARHGEF5Q12774 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
ARHGEF5Q12774 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
ARHGEF5Q12774 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
ARHGEF5Q12774 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
ARHGEF5Q12774 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
ARHGEF5Q12774 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
ARHGEF5Q12774 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
ARHGEF5Q12774 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
ARHGEF5Q12774 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
ARHGEF5Q12774 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
ARHGEF5Q12774 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
ARHGEF5Q12774 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
ARHGEF5Q12774 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
ARHGEF5Q12774 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
ARHGEF5Q12774 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
ARHGEF5Q12774 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
ARHGEF5Q12774 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ARHGEF5Q12774 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ARHGEF5Q12774 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
ARHGEF5Q12774 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
ARHGEF5Q12774 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
ARHGEF5Q12774 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
ARHGEF5Q12774 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
ARHGEF5Q12774 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
ARHGEF5Q12774 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
ARHGEF5Q12774 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
ARHGEF5Q12774 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
ARHGEF5Q12774 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
ARHGEF5Q12774 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
ARHGEF5Q12774 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
ARHGEF5Q12774 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
ARHGEF5Q12774 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
ARHGEF5Q12774 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
ARHGEF5Q12774 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
ARHGEF5Q12774 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
ARHGEF5Q12774 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
ARHGEF5Q12774 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
ARHGEF5Q12774 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
ARHGEF5Q12774 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC35.94■■■■□ 3.34
ARHGEF5Q12774 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
ARHGEF5Q12774 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
ARHGEF5Q12774 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
ARHGEF5Q12774 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
ARHGEF5Q12774 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
ARHGEF5Q12774 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
ARHGEF5Q12774 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
ARHGEF5Q12774 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
ARHGEF5Q12774 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
ARHGEF5Q12774 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
ARHGEF5Q12774 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
ARHGEF5Q12774 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
ARHGEF5Q12774 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
ARHGEF5Q12774 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
ARHGEF5Q12774 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
ARHGEF5Q12774 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
ARHGEF5Q12774 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
ARHGEF5Q12774 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
ARHGEF5Q12774 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
ARHGEF5Q12774 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
ARHGEF5Q12774 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
ARHGEF5Q12774 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
ARHGEF5Q12774 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC35.9■■■■□ 3.34
ARHGEF5Q12774 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
ARHGEF5Q12774 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
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