Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM27E3Q08E93 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM27E3Q08E93 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FAM27E3Q08E93 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FAM27E3Q08E93 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FAM27E3Q08E93 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FAM27E3Q08E93 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FAM27E3Q08E93 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FAM27E3Q08E93 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FAM27E3Q08E93 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
FAM27E3Q08E93 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
FAM27E3Q08E93 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FAM27E3Q08E93 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
FAM27E3Q08E93 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
FAM27E3Q08E93 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM27E3Q08E93 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM27E3Q08E93 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM27E3Q08E93 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM27E3Q08E93 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM27E3Q08E93 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM27E3Q08E93 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM27E3Q08E93 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM27E3Q08E93 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM27E3Q08E93 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM27E3Q08E93 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM27E3Q08E93 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM27E3Q08E93 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM27E3Q08E93 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM27E3Q08E93 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM27E3Q08E93 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM27E3Q08E93 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM27E3Q08E93 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM27E3Q08E93 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM27E3Q08E93 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM27E3Q08E93 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM27E3Q08E93 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM27E3Q08E93 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM27E3Q08E93 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM27E3Q08E93 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM27E3Q08E93 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM27E3Q08E93 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM27E3Q08E93 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM27E3Q08E93 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM27E3Q08E93 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM27E3Q08E93 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM27E3Q08E93 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM27E3Q08E93 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM27E3Q08E93 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM27E3Q08E93 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM27E3Q08E93 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM27E3Q08E93 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM27E3Q08E93 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM27E3Q08E93 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM27E3Q08E93 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM27E3Q08E93 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM27E3Q08E93 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM27E3Q08E93 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM27E3Q08E93 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM27E3Q08E93 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM27E3Q08E93 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM27E3Q08E93 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM27E3Q08E93 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM27E3Q08E93 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM27E3Q08E93 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM27E3Q08E93 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM27E3Q08E93 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
FAM27E3Q08E93 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM27E3Q08E93 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM27E3Q08E93 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM27E3Q08E93 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM27E3Q08E93 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM27E3Q08E93 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM27E3Q08E93 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM27E3Q08E93 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM27E3Q08E93 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM27E3Q08E93 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM27E3Q08E93 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM27E3Q08E93 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM27E3Q08E93 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM27E3Q08E93 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM27E3Q08E93 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM27E3Q08E93 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM27E3Q08E93 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM27E3Q08E93 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM27E3Q08E93 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM27E3Q08E93 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM27E3Q08E93 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM27E3Q08E93 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM27E3Q08E93 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM27E3Q08E93 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM27E3Q08E93 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM27E3Q08E93 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM27E3Q08E93 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM27E3Q08E93 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM27E3Q08E93 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM27E3Q08E93 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM27E3Q08E93 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM27E3Q08E93 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM27E3Q08E93 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM27E3Q08E93 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms