Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDE4DQ08499 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PDE4DQ08499 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDE4DQ08499 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDE4DQ08499 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDE4DQ08499 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDE4DQ08499 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDE4DQ08499 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDE4DQ08499 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDE4DQ08499 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDE4DQ08499 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDE4DQ08499 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDE4DQ08499 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PDE4DQ08499 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDE4DQ08499 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDE4DQ08499 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDE4DQ08499 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDE4DQ08499 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDE4DQ08499 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDE4DQ08499 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDE4DQ08499 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDE4DQ08499 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE4DQ08499 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE4DQ08499 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE4DQ08499 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE4DQ08499 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE4DQ08499 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE4DQ08499 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE4DQ08499 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE4DQ08499 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE4DQ08499 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE4DQ08499 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE4DQ08499 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE4DQ08499 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE4DQ08499 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE4DQ08499 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE4DQ08499 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE4DQ08499 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE4DQ08499 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE4DQ08499 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE4DQ08499 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE4DQ08499 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE4DQ08499 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE4DQ08499 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE4DQ08499 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE4DQ08499 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDE4DQ08499 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDE4DQ08499 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PDE4DQ08499 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDE4DQ08499 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDE4DQ08499 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDE4DQ08499 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDE4DQ08499 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE4DQ08499 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE4DQ08499 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE4DQ08499 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE4DQ08499 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE4DQ08499 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE4DQ08499 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE4DQ08499 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE4DQ08499 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE4DQ08499 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE4DQ08499 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE4DQ08499 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE4DQ08499 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE4DQ08499 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE4DQ08499 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDE4DQ08499 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDE4DQ08499 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PDE4DQ08499 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PDE4DQ08499 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDE4DQ08499 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE4DQ08499 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE4DQ08499 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE4DQ08499 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE4DQ08499 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE4DQ08499 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE4DQ08499 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE4DQ08499 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDE4DQ08499 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PDE4DQ08499 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDE4DQ08499 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDE4DQ08499 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDE4DQ08499 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDE4DQ08499 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDE4DQ08499 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDE4DQ08499 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDE4DQ08499 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDE4DQ08499 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDE4DQ08499 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDE4DQ08499 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PDE4DQ08499 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE4DQ08499 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE4DQ08499 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE4DQ08499 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE4DQ08499 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE4DQ08499 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE4DQ08499 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE4DQ08499 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE4DQ08499 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.8 ms