Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LOXL1Q08397 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LOXL1Q08397 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LOXL1Q08397 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LOXL1Q08397 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LOXL1Q08397 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LOXL1Q08397 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LOXL1Q08397 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LOXL1Q08397 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LOXL1Q08397 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LOXL1Q08397 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LOXL1Q08397 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LOXL1Q08397 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LOXL1Q08397 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
LOXL1Q08397 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
LOXL1Q08397 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
LOXL1Q08397 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
LOXL1Q08397 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LOXL1Q08397 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LOXL1Q08397 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LOXL1Q08397 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LOXL1Q08397 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LOXL1Q08397 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LOXL1Q08397 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
LOXL1Q08397 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
LOXL1Q08397 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LOXL1Q08397 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
LOXL1Q08397 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LOXL1Q08397 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LOXL1Q08397 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LOXL1Q08397 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LOXL1Q08397 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LOXL1Q08397 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LOXL1Q08397 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LOXL1Q08397 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LOXL1Q08397 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
LOXL1Q08397 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LOXL1Q08397 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LOXL1Q08397 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LOXL1Q08397 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LOXL1Q08397 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LOXL1Q08397 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LOXL1Q08397 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
LOXL1Q08397 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LOXL1Q08397 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LOXL1Q08397 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LOXL1Q08397 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LOXL1Q08397 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LOXL1Q08397 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LOXL1Q08397 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LOXL1Q08397 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LOXL1Q08397 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LOXL1Q08397 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LOXL1Q08397 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LOXL1Q08397 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LOXL1Q08397 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LOXL1Q08397 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LOXL1Q08397 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LOXL1Q08397 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
LOXL1Q08397 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LOXL1Q08397 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LOXL1Q08397 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LOXL1Q08397 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LOXL1Q08397 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LOXL1Q08397 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LOXL1Q08397 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LOXL1Q08397 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LOXL1Q08397 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LOXL1Q08397 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LOXL1Q08397 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LOXL1Q08397 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LOXL1Q08397 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LOXL1Q08397 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LOXL1Q08397 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LOXL1Q08397 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LOXL1Q08397 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LOXL1Q08397 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LOXL1Q08397 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LOXL1Q08397 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LOXL1Q08397 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LOXL1Q08397 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
LOXL1Q08397 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LOXL1Q08397 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LOXL1Q08397 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LOXL1Q08397 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LOXL1Q08397 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LOXL1Q08397 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
LOXL1Q08397 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LOXL1Q08397 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LOXL1Q08397 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LOXL1Q08397 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LOXL1Q08397 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LOXL1Q08397 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LOXL1Q08397 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LOXL1Q08397 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LOXL1Q08397 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LOXL1Q08397 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LOXL1Q08397 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LOXL1Q08397 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LOXL1Q08397 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms