Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TFF3Q07654 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TFF3Q07654 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TFF3Q07654 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TFF3Q07654 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TFF3Q07654 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TFF3Q07654 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TFF3Q07654 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TFF3Q07654 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TFF3Q07654 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TFF3Q07654 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TFF3Q07654 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TFF3Q07654 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TFF3Q07654 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TFF3Q07654 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TFF3Q07654 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TFF3Q07654 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TFF3Q07654 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TFF3Q07654 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TFF3Q07654 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TFF3Q07654 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TFF3Q07654 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TFF3Q07654 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TFF3Q07654 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TFF3Q07654 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TFF3Q07654 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TFF3Q07654 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TFF3Q07654 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TFF3Q07654 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TFF3Q07654 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TFF3Q07654 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFF3Q07654 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFF3Q07654 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFF3Q07654 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFF3Q07654 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFF3Q07654 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFF3Q07654 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFF3Q07654 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFF3Q07654 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFF3Q07654 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFF3Q07654 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFF3Q07654 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFF3Q07654 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFF3Q07654 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFF3Q07654 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFF3Q07654 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFF3Q07654 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFF3Q07654 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFF3Q07654 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFF3Q07654 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFF3Q07654 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TFF3Q07654 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFF3Q07654 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFF3Q07654 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TFF3Q07654 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TFF3Q07654 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TFF3Q07654 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TFF3Q07654 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TFF3Q07654 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TFF3Q07654 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TFF3Q07654 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TFF3Q07654 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TFF3Q07654 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TFF3Q07654 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TFF3Q07654 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TFF3Q07654 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TFF3Q07654 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TFF3Q07654 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TFF3Q07654 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TFF3Q07654 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TFF3Q07654 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TFF3Q07654 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TFF3Q07654 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TFF3Q07654 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TFF3Q07654 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TFF3Q07654 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TFF3Q07654 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TFF3Q07654 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TFF3Q07654 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TFF3Q07654 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TFF3Q07654 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TFF3Q07654 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TFF3Q07654 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TFF3Q07654 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TFF3Q07654 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFF3Q07654 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFF3Q07654 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFF3Q07654 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TFF3Q07654 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFF3Q07654 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFF3Q07654 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFF3Q07654 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TFF3Q07654 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TFF3Q07654 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TFF3Q07654 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TFF3Q07654 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TFF3Q07654 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TFF3Q07654 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TFF3Q07654 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TFF3Q07654 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms