Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DEUP1Q05D60 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DEUP1Q05D60 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DEUP1Q05D60 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DEUP1Q05D60 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DEUP1Q05D60 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
DEUP1Q05D60 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DEUP1Q05D60 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DEUP1Q05D60 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DEUP1Q05D60 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DEUP1Q05D60 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DEUP1Q05D60 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DEUP1Q05D60 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DEUP1Q05D60 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DEUP1Q05D60 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DEUP1Q05D60 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DEUP1Q05D60 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DEUP1Q05D60 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DEUP1Q05D60 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DEUP1Q05D60 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DEUP1Q05D60 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DEUP1Q05D60 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DEUP1Q05D60 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DEUP1Q05D60 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DEUP1Q05D60 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DEUP1Q05D60 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DEUP1Q05D60 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DEUP1Q05D60 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DEUP1Q05D60 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DEUP1Q05D60 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DEUP1Q05D60 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DEUP1Q05D60 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
DEUP1Q05D60 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DEUP1Q05D60 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DEUP1Q05D60 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DEUP1Q05D60 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DEUP1Q05D60 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DEUP1Q05D60 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DEUP1Q05D60 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DEUP1Q05D60 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DEUP1Q05D60 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DEUP1Q05D60 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DEUP1Q05D60 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DEUP1Q05D60 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DEUP1Q05D60 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DEUP1Q05D60 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DEUP1Q05D60 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DEUP1Q05D60 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DEUP1Q05D60 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DEUP1Q05D60 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DEUP1Q05D60 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DEUP1Q05D60 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DEUP1Q05D60 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DEUP1Q05D60 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DEUP1Q05D60 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DEUP1Q05D60 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DEUP1Q05D60 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DEUP1Q05D60 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DEUP1Q05D60 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DEUP1Q05D60 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DEUP1Q05D60 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DEUP1Q05D60 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DEUP1Q05D60 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DEUP1Q05D60 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DEUP1Q05D60 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DEUP1Q05D60 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DEUP1Q05D60 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DEUP1Q05D60 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DEUP1Q05D60 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DEUP1Q05D60 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DEUP1Q05D60 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DEUP1Q05D60 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DEUP1Q05D60 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DEUP1Q05D60 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DEUP1Q05D60 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DEUP1Q05D60 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DEUP1Q05D60 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DEUP1Q05D60 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DEUP1Q05D60 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DEUP1Q05D60 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DEUP1Q05D60 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DEUP1Q05D60 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DEUP1Q05D60 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DEUP1Q05D60 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DEUP1Q05D60 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DEUP1Q05D60 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
DEUP1Q05D60 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DEUP1Q05D60 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DEUP1Q05D60 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DEUP1Q05D60 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DEUP1Q05D60 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DEUP1Q05D60 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DEUP1Q05D60 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DEUP1Q05D60 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DEUP1Q05D60 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DEUP1Q05D60 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DEUP1Q05D60 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
DEUP1Q05D60 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DEUP1Q05D60 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DEUP1Q05D60 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms