Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NUCB1Q02818 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NUCB1Q02818 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NUCB1Q02818 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NUCB1Q02818 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NUCB1Q02818 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NUCB1Q02818 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NUCB1Q02818 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
NUCB1Q02818 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NUCB1Q02818 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUCB1Q02818 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUCB1Q02818 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUCB1Q02818 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUCB1Q02818 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUCB1Q02818 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUCB1Q02818 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUCB1Q02818 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUCB1Q02818 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NUCB1Q02818 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NUCB1Q02818 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NUCB1Q02818 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NUCB1Q02818 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NUCB1Q02818 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
NUCB1Q02818 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NUCB1Q02818 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NUCB1Q02818 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NUCB1Q02818 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
NUCB1Q02818 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NUCB1Q02818 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUCB1Q02818 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUCB1Q02818 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUCB1Q02818 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUCB1Q02818 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
NUCB1Q02818 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
NUCB1Q02818 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUCB1Q02818 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUCB1Q02818 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUCB1Q02818 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUCB1Q02818 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUCB1Q02818 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUCB1Q02818 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUCB1Q02818 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUCB1Q02818 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUCB1Q02818 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUCB1Q02818 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUCB1Q02818 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUCB1Q02818 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUCB1Q02818 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUCB1Q02818 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUCB1Q02818 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NUCB1Q02818 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NUCB1Q02818 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NUCB1Q02818 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NUCB1Q02818 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NUCB1Q02818 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NUCB1Q02818 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NUCB1Q02818 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NUCB1Q02818 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NUCB1Q02818 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NUCB1Q02818 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NUCB1Q02818 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NUCB1Q02818 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUCB1Q02818 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUCB1Q02818 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUCB1Q02818 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUCB1Q02818 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUCB1Q02818 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUCB1Q02818 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUCB1Q02818 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUCB1Q02818 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUCB1Q02818 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUCB1Q02818 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
NUCB1Q02818 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUCB1Q02818 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUCB1Q02818 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUCB1Q02818 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
NUCB1Q02818 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUCB1Q02818 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUCB1Q02818 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUCB1Q02818 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUCB1Q02818 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUCB1Q02818 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUCB1Q02818 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUCB1Q02818 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUCB1Q02818 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
NUCB1Q02818 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUCB1Q02818 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUCB1Q02818 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUCB1Q02818 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUCB1Q02818 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUCB1Q02818 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUCB1Q02818 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUCB1Q02818 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUCB1Q02818 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUCB1Q02818 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUCB1Q02818 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUCB1Q02818 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUCB1Q02818 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUCB1Q02818 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUCB1Q02818 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms