Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSC2Q02487 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSC2Q02487 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSC2Q02487 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSC2Q02487 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSC2Q02487 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSC2Q02487 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSC2Q02487 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSC2Q02487 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSC2Q02487 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DSC2Q02487 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DSC2Q02487 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSC2Q02487 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSC2Q02487 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DSC2Q02487 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DSC2Q02487 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DSC2Q02487 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DSC2Q02487 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DSC2Q02487 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
DSC2Q02487 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DSC2Q02487 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DSC2Q02487 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DSC2Q02487 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DSC2Q02487 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSC2Q02487 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSC2Q02487 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSC2Q02487 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSC2Q02487 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSC2Q02487 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSC2Q02487 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSC2Q02487 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSC2Q02487 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSC2Q02487 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSC2Q02487 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSC2Q02487 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSC2Q02487 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSC2Q02487 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSC2Q02487 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSC2Q02487 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSC2Q02487 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSC2Q02487 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSC2Q02487 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSC2Q02487 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSC2Q02487 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSC2Q02487 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSC2Q02487 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSC2Q02487 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSC2Q02487 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DSC2Q02487 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSC2Q02487 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSC2Q02487 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSC2Q02487 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DSC2Q02487 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DSC2Q02487 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DSC2Q02487 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DSC2Q02487 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DSC2Q02487 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSC2Q02487 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSC2Q02487 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSC2Q02487 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSC2Q02487 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DSC2Q02487 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DSC2Q02487 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DSC2Q02487 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DSC2Q02487 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DSC2Q02487 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms