Protein–RNA interactions for Protein: Q02221

COX6A2, Cytochrome c oxidase subunit 6A2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A2Q02221 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms