Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PLCB3Q01970 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PLCB3Q01970 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PLCB3Q01970 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PLCB3Q01970 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PLCB3Q01970 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PLCB3Q01970 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PLCB3Q01970 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PLCB3Q01970 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLCB3Q01970 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLCB3Q01970 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLCB3Q01970 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLCB3Q01970 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLCB3Q01970 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLCB3Q01970 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLCB3Q01970 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLCB3Q01970 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLCB3Q01970 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLCB3Q01970 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLCB3Q01970 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLCB3Q01970 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PLCB3Q01970 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLCB3Q01970 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLCB3Q01970 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PLCB3Q01970 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PLCB3Q01970 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLCB3Q01970 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLCB3Q01970 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PLCB3Q01970 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PLCB3Q01970 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PLCB3Q01970 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PLCB3Q01970 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PLCB3Q01970 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PLCB3Q01970 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PLCB3Q01970 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PLCB3Q01970 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PLCB3Q01970 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PLCB3Q01970 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PLCB3Q01970 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PLCB3Q01970 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PLCB3Q01970 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PLCB3Q01970 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PLCB3Q01970 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PLCB3Q01970 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PLCB3Q01970 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PLCB3Q01970 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PLCB3Q01970 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PLCB3Q01970 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PLCB3Q01970 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PLCB3Q01970 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PLCB3Q01970 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PLCB3Q01970 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PLCB3Q01970 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PLCB3Q01970 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PLCB3Q01970 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PLCB3Q01970 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PLCB3Q01970 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLCB3Q01970 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLCB3Q01970 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLCB3Q01970 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLCB3Q01970 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLCB3Q01970 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLCB3Q01970 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLCB3Q01970 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLCB3Q01970 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLCB3Q01970 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLCB3Q01970 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLCB3Q01970 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PLCB3Q01970 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLCB3Q01970 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLCB3Q01970 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLCB3Q01970 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLCB3Q01970 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLCB3Q01970 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLCB3Q01970 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLCB3Q01970 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLCB3Q01970 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLCB3Q01970 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLCB3Q01970 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLCB3Q01970 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLCB3Q01970 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLCB3Q01970 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PLCB3Q01970 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLCB3Q01970 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLCB3Q01970 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLCB3Q01970 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLCB3Q01970 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLCB3Q01970 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLCB3Q01970 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PLCB3Q01970 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLCB3Q01970 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLCB3Q01970 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLCB3Q01970 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLCB3Q01970 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLCB3Q01970 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLCB3Q01970 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLCB3Q01970 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLCB3Q01970 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLCB3Q01970 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLCB3Q01970 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms