Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPIBQ01892 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPIBQ01892 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPIBQ01892 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPIBQ01892 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPIBQ01892 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPIBQ01892 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPIBQ01892 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPIBQ01892 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPIBQ01892 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPIBQ01892 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPIBQ01892 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPIBQ01892 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPIBQ01892 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPIBQ01892 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPIBQ01892 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPIBQ01892 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPIBQ01892 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPIBQ01892 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPIBQ01892 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPIBQ01892 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPIBQ01892 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPIBQ01892 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SPIBQ01892 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPIBQ01892 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPIBQ01892 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPIBQ01892 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPIBQ01892 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPIBQ01892 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPIBQ01892 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPIBQ01892 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPIBQ01892 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPIBQ01892 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPIBQ01892 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPIBQ01892 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPIBQ01892 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPIBQ01892 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPIBQ01892 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPIBQ01892 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPIBQ01892 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPIBQ01892 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPIBQ01892 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPIBQ01892 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPIBQ01892 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPIBQ01892 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SPIBQ01892 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPIBQ01892 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPIBQ01892 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPIBQ01892 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPIBQ01892 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPIBQ01892 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPIBQ01892 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPIBQ01892 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPIBQ01892 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPIBQ01892 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPIBQ01892 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SPIBQ01892 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPIBQ01892 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPIBQ01892 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPIBQ01892 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPIBQ01892 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPIBQ01892 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPIBQ01892 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPIBQ01892 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPIBQ01892 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPIBQ01892 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPIBQ01892 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPIBQ01892 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPIBQ01892 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPIBQ01892 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPIBQ01892 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPIBQ01892 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPIBQ01892 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPIBQ01892 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPIBQ01892 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPIBQ01892 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPIBQ01892 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPIBQ01892 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPIBQ01892 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPIBQ01892 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPIBQ01892 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPIBQ01892 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPIBQ01892 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPIBQ01892 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPIBQ01892 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPIBQ01892 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPIBQ01892 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPIBQ01892 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPIBQ01892 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPIBQ01892 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPIBQ01892 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPIBQ01892 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPIBQ01892 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SPIBQ01892 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPIBQ01892 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPIBQ01892 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPIBQ01892 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPIBQ01892 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPIBQ01892 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPIBQ01892 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.3 ms