Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DEFA6Q01524 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DEFA6Q01524 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DEFA6Q01524 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DEFA6Q01524 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DEFA6Q01524 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEFA6Q01524 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEFA6Q01524 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEFA6Q01524 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEFA6Q01524 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEFA6Q01524 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEFA6Q01524 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEFA6Q01524 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEFA6Q01524 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEFA6Q01524 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEFA6Q01524 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEFA6Q01524 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEFA6Q01524 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEFA6Q01524 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEFA6Q01524 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEFA6Q01524 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEFA6Q01524 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEFA6Q01524 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEFA6Q01524 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEFA6Q01524 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEFA6Q01524 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEFA6Q01524 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEFA6Q01524 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEFA6Q01524 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEFA6Q01524 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEFA6Q01524 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEFA6Q01524 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DEFA6Q01524 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DEFA6Q01524 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DEFA6Q01524 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
DEFA6Q01524 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DEFA6Q01524 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DEFA6Q01524 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DEFA6Q01524 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DEFA6Q01524 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DEFA6Q01524 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DEFA6Q01524 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DEFA6Q01524 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DEFA6Q01524 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DEFA6Q01524 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEFA6Q01524 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DEFA6Q01524 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEFA6Q01524 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEFA6Q01524 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEFA6Q01524 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEFA6Q01524 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DEFA6Q01524 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DEFA6Q01524 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DEFA6Q01524 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DEFA6Q01524 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DEFA6Q01524 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DEFA6Q01524 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DEFA6Q01524 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms