Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SCN7AQ01118 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SCN7AQ01118 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SCN7AQ01118 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SCN7AQ01118 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SCN7AQ01118 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SCN7AQ01118 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SCN7AQ01118 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SCN7AQ01118 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SCN7AQ01118 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SCN7AQ01118 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SCN7AQ01118 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SCN7AQ01118 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SCN7AQ01118 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SCN7AQ01118 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
SCN7AQ01118 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SCN7AQ01118 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SCN7AQ01118 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SCN7AQ01118 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SCN7AQ01118 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SCN7AQ01118 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
SCN7AQ01118 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
SCN7AQ01118 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
SCN7AQ01118 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
SCN7AQ01118 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SCN7AQ01118 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
SCN7AQ01118 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
SCN7AQ01118 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SCN7AQ01118 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SCN7AQ01118 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SCN7AQ01118 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SCN7AQ01118 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
SCN7AQ01118 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SCN7AQ01118 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SCN7AQ01118 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SCN7AQ01118 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SCN7AQ01118 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SCN7AQ01118 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SCN7AQ01118 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
SCN7AQ01118 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SCN7AQ01118 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SCN7AQ01118 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SCN7AQ01118 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SCN7AQ01118 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
SCN7AQ01118 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SCN7AQ01118 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SCN7AQ01118 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
SCN7AQ01118 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
SCN7AQ01118 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SCN7AQ01118 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
SCN7AQ01118 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SCN7AQ01118 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
SCN7AQ01118 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SCN7AQ01118 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SCN7AQ01118 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SCN7AQ01118 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SCN7AQ01118 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SCN7AQ01118 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SCN7AQ01118 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SCN7AQ01118 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SCN7AQ01118 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SCN7AQ01118 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SCN7AQ01118 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SCN7AQ01118 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
SCN7AQ01118 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SCN7AQ01118 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SCN7AQ01118 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SCN7AQ01118 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SCN7AQ01118 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SCN7AQ01118 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SCN7AQ01118 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SCN7AQ01118 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
SCN7AQ01118 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SCN7AQ01118 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SCN7AQ01118 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SCN7AQ01118 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SCN7AQ01118 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.41
SCN7AQ01118 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SCN7AQ01118 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SCN7AQ01118 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SCN7AQ01118 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SCN7AQ01118 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SCN7AQ01118 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SCN7AQ01118 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SCN7AQ01118 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SCN7AQ01118 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SCN7AQ01118 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SCN7AQ01118 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SCN7AQ01118 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SCN7AQ01118 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SCN7AQ01118 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SCN7AQ01118 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SCN7AQ01118 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SCN7AQ01118 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SCN7AQ01118 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SCN7AQ01118 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SCN7AQ01118 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
SCN7AQ01118 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SCN7AQ01118 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SCN7AQ01118 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 194.4 ms