Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYBPC1Q00872 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYBPC1Q00872 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYBPC1Q00872 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYBPC1Q00872 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYBPC1Q00872 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYBPC1Q00872 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYBPC1Q00872 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYBPC1Q00872 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYBPC1Q00872 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYBPC1Q00872 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYBPC1Q00872 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYBPC1Q00872 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYBPC1Q00872 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYBPC1Q00872 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYBPC1Q00872 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYBPC1Q00872 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MYBPC1Q00872 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MYBPC1Q00872 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MYBPC1Q00872 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MYBPC1Q00872 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MYBPC1Q00872 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MYBPC1Q00872 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MYBPC1Q00872 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MYBPC1Q00872 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MYBPC1Q00872 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYBPC1Q00872 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYBPC1Q00872 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYBPC1Q00872 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYBPC1Q00872 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYBPC1Q00872 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYBPC1Q00872 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYBPC1Q00872 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYBPC1Q00872 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYBPC1Q00872 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYBPC1Q00872 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYBPC1Q00872 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYBPC1Q00872 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYBPC1Q00872 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYBPC1Q00872 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYBPC1Q00872 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYBPC1Q00872 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYBPC1Q00872 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYBPC1Q00872 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYBPC1Q00872 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYBPC1Q00872 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYBPC1Q00872 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYBPC1Q00872 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYBPC1Q00872 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYBPC1Q00872 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYBPC1Q00872 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYBPC1Q00872 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYBPC1Q00872 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYBPC1Q00872 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYBPC1Q00872 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYBPC1Q00872 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYBPC1Q00872 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYBPC1Q00872 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYBPC1Q00872 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYBPC1Q00872 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYBPC1Q00872 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYBPC1Q00872 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MYBPC1Q00872 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MYBPC1Q00872 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYBPC1Q00872 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYBPC1Q00872 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYBPC1Q00872 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYBPC1Q00872 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYBPC1Q00872 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYBPC1Q00872 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYBPC1Q00872 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYBPC1Q00872 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYBPC1Q00872 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYBPC1Q00872 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYBPC1Q00872 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYBPC1Q00872 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYBPC1Q00872 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYBPC1Q00872 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYBPC1Q00872 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYBPC1Q00872 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYBPC1Q00872 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYBPC1Q00872 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYBPC1Q00872 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYBPC1Q00872 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYBPC1Q00872 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYBPC1Q00872 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYBPC1Q00872 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYBPC1Q00872 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MYBPC1Q00872 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYBPC1Q00872 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYBPC1Q00872 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MYBPC1Q00872 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYBPC1Q00872 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYBPC1Q00872 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYBPC1Q00872 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYBPC1Q00872 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYBPC1Q00872 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYBPC1Q00872 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYBPC1Q00872 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYBPC1Q00872 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms