Protein–RNA interactions for Protein: P98196

ATP11A, Probable phospholipid-transporting ATPase IH, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11AP98196 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP11AP98196 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP11AP98196 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP11AP98196 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP11AP98196 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP11AP98196 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP11AP98196 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP11AP98196 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP11AP98196 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP11AP98196 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP11AP98196 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP11AP98196 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP11AP98196 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP11AP98196 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP11AP98196 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP11AP98196 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP11AP98196 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP11AP98196 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP11AP98196 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP11AP98196 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP11AP98196 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP11AP98196 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP11AP98196 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP11AP98196 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP11AP98196 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP11AP98196 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATP11AP98196 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP11AP98196 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP11AP98196 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP11AP98196 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP11AP98196 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP11AP98196 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP11AP98196 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP11AP98196 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP11AP98196 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP11AP98196 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP11AP98196 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP11AP98196 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP11AP98196 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP11AP98196 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP11AP98196 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP11AP98196 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP11AP98196 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP11AP98196 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP11AP98196 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP11AP98196 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP11AP98196 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP11AP98196 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP11AP98196 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP11AP98196 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP11AP98196 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP11AP98196 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP11AP98196 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP11AP98196 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP11AP98196 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP11AP98196 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP11AP98196 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP11AP98196 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP11AP98196 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP11AP98196 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP11AP98196 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP11AP98196 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP11AP98196 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP11AP98196 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP11AP98196 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP11AP98196 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP11AP98196 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP11AP98196 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP11AP98196 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP11AP98196 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP11AP98196 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP11AP98196 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP11AP98196 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP11AP98196 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP11AP98196 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP11AP98196 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP11AP98196 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP11AP98196 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP11AP98196 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP11AP98196 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP11AP98196 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP11AP98196 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP11AP98196 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP11AP98196 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP11AP98196 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP11AP98196 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP11AP98196 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP11AP98196 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP11AP98196 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP11AP98196 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP11AP98196 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP11AP98196 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP11AP98196 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP11AP98196 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP11AP98196 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP11AP98196 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP11AP98196 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP11AP98196 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP11AP98196 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP11AP98196 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms