Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VLDLRP98155 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VLDLRP98155 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VLDLRP98155 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VLDLRP98155 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VLDLRP98155 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VLDLRP98155 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VLDLRP98155 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VLDLRP98155 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VLDLRP98155 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VLDLRP98155 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VLDLRP98155 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VLDLRP98155 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VLDLRP98155 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VLDLRP98155 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VLDLRP98155 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VLDLRP98155 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VLDLRP98155 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VLDLRP98155 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VLDLRP98155 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VLDLRP98155 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VLDLRP98155 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VLDLRP98155 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VLDLRP98155 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VLDLRP98155 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VLDLRP98155 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VLDLRP98155 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VLDLRP98155 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VLDLRP98155 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VLDLRP98155 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VLDLRP98155 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VLDLRP98155 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VLDLRP98155 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VLDLRP98155 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VLDLRP98155 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VLDLRP98155 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VLDLRP98155 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VLDLRP98155 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VLDLRP98155 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VLDLRP98155 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VLDLRP98155 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VLDLRP98155 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VLDLRP98155 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VLDLRP98155 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VLDLRP98155 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VLDLRP98155 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VLDLRP98155 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VLDLRP98155 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VLDLRP98155 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VLDLRP98155 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VLDLRP98155 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VLDLRP98155 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VLDLRP98155 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VLDLRP98155 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VLDLRP98155 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VLDLRP98155 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VLDLRP98155 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VLDLRP98155 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VLDLRP98155 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VLDLRP98155 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VLDLRP98155 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VLDLRP98155 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VLDLRP98155 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VLDLRP98155 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VLDLRP98155 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
VLDLRP98155 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
VLDLRP98155 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VLDLRP98155 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VLDLRP98155 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VLDLRP98155 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VLDLRP98155 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VLDLRP98155 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VLDLRP98155 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VLDLRP98155 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VLDLRP98155 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VLDLRP98155 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VLDLRP98155 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VLDLRP98155 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
VLDLRP98155 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VLDLRP98155 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VLDLRP98155 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VLDLRP98155 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VLDLRP98155 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VLDLRP98155 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VLDLRP98155 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VLDLRP98155 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VLDLRP98155 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VLDLRP98155 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VLDLRP98155 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VLDLRP98155 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VLDLRP98155 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VLDLRP98155 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VLDLRP98155 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VLDLRP98155 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VLDLRP98155 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VLDLRP98155 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VLDLRP98155 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VLDLRP98155 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VLDLRP98155 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VLDLRP98155 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms