Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED6P86452 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED6P86452 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZBED6P86452 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZBED6P86452 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZBED6P86452 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZBED6P86452 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZBED6P86452 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZBED6P86452 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZBED6P86452 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZBED6P86452 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZBED6P86452 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZBED6P86452 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZBED6P86452 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZBED6P86452 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZBED6P86452 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ZBED6P86452 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ZBED6P86452 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZBED6P86452 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZBED6P86452 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZBED6P86452 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZBED6P86452 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ZBED6P86452 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZBED6P86452 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZBED6P86452 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZBED6P86452 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZBED6P86452 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZBED6P86452 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZBED6P86452 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZBED6P86452 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZBED6P86452 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZBED6P86452 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZBED6P86452 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZBED6P86452 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZBED6P86452 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZBED6P86452 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZBED6P86452 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZBED6P86452 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZBED6P86452 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZBED6P86452 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZBED6P86452 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZBED6P86452 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZBED6P86452 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZBED6P86452 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZBED6P86452 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZBED6P86452 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ZBED6P86452 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZBED6P86452 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZBED6P86452 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZBED6P86452 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZBED6P86452 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZBED6P86452 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZBED6P86452 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZBED6P86452 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZBED6P86452 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ZBED6P86452 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZBED6P86452 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZBED6P86452 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZBED6P86452 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZBED6P86452 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZBED6P86452 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZBED6P86452 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZBED6P86452 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZBED6P86452 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZBED6P86452 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZBED6P86452 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZBED6P86452 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZBED6P86452 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZBED6P86452 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZBED6P86452 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ZBED6P86452 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZBED6P86452 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZBED6P86452 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZBED6P86452 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZBED6P86452 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZBED6P86452 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZBED6P86452 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZBED6P86452 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZBED6P86452 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ZBED6P86452 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZBED6P86452 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZBED6P86452 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZBED6P86452 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZBED6P86452 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZBED6P86452 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZBED6P86452 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZBED6P86452 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZBED6P86452 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZBED6P86452 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZBED6P86452 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZBED6P86452 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZBED6P86452 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZBED6P86452 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZBED6P86452 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZBED6P86452 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZBED6P86452 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZBED6P86452 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZBED6P86452 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZBED6P86452 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZBED6P86452 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms