Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMAD3P84022 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMAD3P84022 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMAD3P84022 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SMAD3P84022 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMAD3P84022 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMAD3P84022 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMAD3P84022 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SMAD3P84022 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMAD3P84022 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMAD3P84022 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMAD3P84022 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMAD3P84022 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMAD3P84022 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMAD3P84022 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMAD3P84022 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMAD3P84022 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMAD3P84022 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMAD3P84022 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMAD3P84022 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMAD3P84022 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMAD3P84022 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMAD3P84022 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMAD3P84022 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMAD3P84022 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMAD3P84022 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SMAD3P84022 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMAD3P84022 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMAD3P84022 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMAD3P84022 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMAD3P84022 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SMAD3P84022 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMAD3P84022 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMAD3P84022 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SMAD3P84022 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMAD3P84022 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMAD3P84022 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMAD3P84022 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMAD3P84022 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMAD3P84022 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMAD3P84022 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMAD3P84022 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMAD3P84022 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMAD3P84022 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMAD3P84022 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SMAD3P84022 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMAD3P84022 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMAD3P84022 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMAD3P84022 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMAD3P84022 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMAD3P84022 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMAD3P84022 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMAD3P84022 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMAD3P84022 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SMAD3P84022 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMAD3P84022 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMAD3P84022 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMAD3P84022 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMAD3P84022 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMAD3P84022 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMAD3P84022 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMAD3P84022 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMAD3P84022 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMAD3P84022 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMAD3P84022 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMAD3P84022 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMAD3P84022 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMAD3P84022 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMAD3P84022 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMAD3P84022 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SMAD3P84022 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMAD3P84022 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMAD3P84022 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMAD3P84022 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMAD3P84022 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMAD3P84022 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMAD3P84022 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMAD3P84022 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SMAD3P84022 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMAD3P84022 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMAD3P84022 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMAD3P84022 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMAD3P84022 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMAD3P84022 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SMAD3P84022 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMAD3P84022 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMAD3P84022 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMAD3P84022 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMAD3P84022 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMAD3P84022 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMAD3P84022 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMAD3P84022 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMAD3P84022 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMAD3P84022 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMAD3P84022 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMAD3P84022 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMAD3P84022 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMAD3P84022 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMAD3P84022 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMAD3P84022 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms