Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSBP2P81877 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSBP2P81877 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSBP2P81877 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSBP2P81877 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSBP2P81877 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSBP2P81877 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSBP2P81877 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSBP2P81877 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSBP2P81877 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSBP2P81877 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSBP2P81877 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSBP2P81877 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSBP2P81877 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSBP2P81877 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSBP2P81877 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSBP2P81877 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSBP2P81877 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSBP2P81877 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSBP2P81877 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSBP2P81877 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSBP2P81877 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSBP2P81877 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSBP2P81877 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSBP2P81877 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSBP2P81877 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSBP2P81877 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SSBP2P81877 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSBP2P81877 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SSBP2P81877 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSBP2P81877 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSBP2P81877 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSBP2P81877 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSBP2P81877 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SSBP2P81877 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SSBP2P81877 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSBP2P81877 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SSBP2P81877 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSBP2P81877 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSBP2P81877 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSBP2P81877 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSBP2P81877 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSBP2P81877 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSBP2P81877 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SSBP2P81877 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SSBP2P81877 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSBP2P81877 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSBP2P81877 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSBP2P81877 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSBP2P81877 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSBP2P81877 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSBP2P81877 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSBP2P81877 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSBP2P81877 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SSBP2P81877 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSBP2P81877 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSBP2P81877 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSBP2P81877 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSBP2P81877 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSBP2P81877 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSBP2P81877 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSBP2P81877 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSBP2P81877 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSBP2P81877 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSBP2P81877 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSBP2P81877 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSBP2P81877 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSBP2P81877 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSBP2P81877 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSBP2P81877 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSBP2P81877 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSBP2P81877 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSBP2P81877 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSBP2P81877 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSBP2P81877 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSBP2P81877 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSBP2P81877 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSBP2P81877 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSBP2P81877 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSBP2P81877 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSBP2P81877 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSBP2P81877 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSBP2P81877 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSBP2P81877 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSBP2P81877 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSBP2P81877 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSBP2P81877 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSBP2P81877 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSBP2P81877 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSBP2P81877 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSBP2P81877 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSBP2P81877 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSBP2P81877 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSBP2P81877 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSBP2P81877 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SSBP2P81877 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSBP2P81877 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSBP2P81877 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSBP2P81877 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms