Protein–RNA interactions for Protein: P78324

SIRPA, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type substrate 1, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRPAP78324 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIRPAP78324 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIRPAP78324 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIRPAP78324 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIRPAP78324 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIRPAP78324 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIRPAP78324 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIRPAP78324 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIRPAP78324 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SIRPAP78324 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIRPAP78324 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIRPAP78324 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIRPAP78324 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIRPAP78324 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIRPAP78324 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIRPAP78324 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIRPAP78324 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIRPAP78324 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIRPAP78324 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIRPAP78324 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIRPAP78324 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIRPAP78324 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIRPAP78324 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SIRPAP78324 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIRPAP78324 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIRPAP78324 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIRPAP78324 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIRPAP78324 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SIRPAP78324 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SIRPAP78324 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIRPAP78324 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIRPAP78324 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIRPAP78324 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIRPAP78324 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SIRPAP78324 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIRPAP78324 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIRPAP78324 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIRPAP78324 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIRPAP78324 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIRPAP78324 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIRPAP78324 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIRPAP78324 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIRPAP78324 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIRPAP78324 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIRPAP78324 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIRPAP78324 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIRPAP78324 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIRPAP78324 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIRPAP78324 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIRPAP78324 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SIRPAP78324 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIRPAP78324 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIRPAP78324 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIRPAP78324 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIRPAP78324 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIRPAP78324 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIRPAP78324 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIRPAP78324 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIRPAP78324 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SIRPAP78324 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIRPAP78324 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIRPAP78324 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIRPAP78324 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIRPAP78324 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIRPAP78324 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIRPAP78324 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIRPAP78324 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIRPAP78324 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIRPAP78324 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIRPAP78324 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SIRPAP78324 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIRPAP78324 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIRPAP78324 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIRPAP78324 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIRPAP78324 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIRPAP78324 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIRPAP78324 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIRPAP78324 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIRPAP78324 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIRPAP78324 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIRPAP78324 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIRPAP78324 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIRPAP78324 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIRPAP78324 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIRPAP78324 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIRPAP78324 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIRPAP78324 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIRPAP78324 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIRPAP78324 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIRPAP78324 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIRPAP78324 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIRPAP78324 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIRPAP78324 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIRPAP78324 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIRPAP78324 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIRPAP78324 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIRPAP78324 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIRPAP78324 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIRPAP78324 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIRPAP78324 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms