Protein–RNA interactions for Protein: P68366

TUBA4A, Tubulin alpha-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4AP68366 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBA4AP68366 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBA4AP68366 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBA4AP68366 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBA4AP68366 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBA4AP68366 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBA4AP68366 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBA4AP68366 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBA4AP68366 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBA4AP68366 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBA4AP68366 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBA4AP68366 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBA4AP68366 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBA4AP68366 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBA4AP68366 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBA4AP68366 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBA4AP68366 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBA4AP68366 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBA4AP68366 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBA4AP68366 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBA4AP68366 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBA4AP68366 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBA4AP68366 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBA4AP68366 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBA4AP68366 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBA4AP68366 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBA4AP68366 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBA4AP68366 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBA4AP68366 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBA4AP68366 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBA4AP68366 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBA4AP68366 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBA4AP68366 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBA4AP68366 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBA4AP68366 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBA4AP68366 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBA4AP68366 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBA4AP68366 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBA4AP68366 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TUBA4AP68366 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBA4AP68366 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBA4AP68366 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBA4AP68366 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBA4AP68366 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBA4AP68366 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBA4AP68366 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBA4AP68366 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBA4AP68366 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBA4AP68366 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBA4AP68366 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBA4AP68366 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBA4AP68366 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBA4AP68366 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBA4AP68366 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBA4AP68366 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBA4AP68366 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBA4AP68366 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBA4AP68366 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBA4AP68366 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBA4AP68366 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBA4AP68366 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBA4AP68366 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBA4AP68366 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBA4AP68366 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBA4AP68366 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBA4AP68366 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBA4AP68366 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBA4AP68366 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBA4AP68366 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBA4AP68366 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBA4AP68366 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBA4AP68366 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBA4AP68366 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBA4AP68366 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBA4AP68366 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBA4AP68366 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBA4AP68366 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBA4AP68366 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBA4AP68366 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBA4AP68366 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBA4AP68366 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBA4AP68366 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBA4AP68366 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBA4AP68366 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBA4AP68366 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBA4AP68366 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBA4AP68366 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms