Protein–RNA interactions for Protein: P63027

VAMP2, Vesicle-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP2P63027 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VAMP2P63027 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VAMP2P63027 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VAMP2P63027 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VAMP2P63027 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VAMP2P63027 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VAMP2P63027 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAMP2P63027 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAMP2P63027 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAMP2P63027 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAMP2P63027 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAMP2P63027 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAMP2P63027 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAMP2P63027 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAMP2P63027 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAMP2P63027 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAMP2P63027 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAMP2P63027 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAMP2P63027 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAMP2P63027 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAMP2P63027 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAMP2P63027 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAMP2P63027 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAMP2P63027 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAMP2P63027 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAMP2P63027 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAMP2P63027 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAMP2P63027 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
VAMP2P63027 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAMP2P63027 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAMP2P63027 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAMP2P63027 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAMP2P63027 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAMP2P63027 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAMP2P63027 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAMP2P63027 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAMP2P63027 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAMP2P63027 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAMP2P63027 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAMP2P63027 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAMP2P63027 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAMP2P63027 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAMP2P63027 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAMP2P63027 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAMP2P63027 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAMP2P63027 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
VAMP2P63027 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VAMP2P63027 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
VAMP2P63027 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VAMP2P63027 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VAMP2P63027 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VAMP2P63027 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VAMP2P63027 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VAMP2P63027 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAMP2P63027 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAMP2P63027 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAMP2P63027 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAMP2P63027 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAMP2P63027 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAMP2P63027 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAMP2P63027 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAMP2P63027 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAMP2P63027 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
VAMP2P63027 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAMP2P63027 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAMP2P63027 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAMP2P63027 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAMP2P63027 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAMP2P63027 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAMP2P63027 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
VAMP2P63027 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAMP2P63027 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAMP2P63027 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAMP2P63027 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAMP2P63027 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAMP2P63027 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAMP2P63027 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAMP2P63027 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAMP2P63027 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAMP2P63027 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAMP2P63027 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAMP2P63027 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAMP2P63027 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAMP2P63027 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAMP2P63027 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAMP2P63027 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAMP2P63027 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
VAMP2P63027 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAMP2P63027 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAMP2P63027 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAMP2P63027 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAMP2P63027 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAMP2P63027 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAMP2P63027 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAMP2P63027 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAMP2P63027 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAMP2P63027 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAMP2P63027 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAMP2P63027 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAMP2P63027 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms