Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBA52P62987 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBA52P62987 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBA52P62987 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBA52P62987 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBA52P62987 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBA52P62987 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBA52P62987 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBA52P62987 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBA52P62987 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBA52P62987 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBA52P62987 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBA52P62987 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBA52P62987 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBA52P62987 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBA52P62987 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBA52P62987 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBA52P62987 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBA52P62987 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBA52P62987 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBA52P62987 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBA52P62987 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBA52P62987 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBA52P62987 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
UBA52P62987 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBA52P62987 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBA52P62987 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBA52P62987 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBA52P62987 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBA52P62987 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBA52P62987 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBA52P62987 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBA52P62987 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
UBA52P62987 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBA52P62987 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
UBA52P62987 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBA52P62987 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBA52P62987 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBA52P62987 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBA52P62987 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBA52P62987 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBA52P62987 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBA52P62987 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBA52P62987 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBA52P62987 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBA52P62987 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBA52P62987 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBA52P62987 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBA52P62987 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBA52P62987 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBA52P62987 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBA52P62987 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBA52P62987 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBA52P62987 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBA52P62987 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBA52P62987 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBA52P62987 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBA52P62987 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBA52P62987 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBA52P62987 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBA52P62987 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBA52P62987 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
UBA52P62987 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBA52P62987 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBA52P62987 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBA52P62987 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBA52P62987 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBA52P62987 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBA52P62987 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBA52P62987 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBA52P62987 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBA52P62987 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBA52P62987 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBA52P62987 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBA52P62987 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBA52P62987 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBA52P62987 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBA52P62987 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBA52P62987 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBA52P62987 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBA52P62987 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBA52P62987 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBA52P62987 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBA52P62987 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBA52P62987 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBA52P62987 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBA52P62987 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBA52P62987 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBA52P62987 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBA52P62987 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBA52P62987 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBA52P62987 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBA52P62987 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
UBA52P62987 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBA52P62987 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBA52P62987 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBA52P62987 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBA52P62987 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBA52P62987 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBA52P62987 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms