Protein–RNA interactions for Protein: P62310

LSM3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM3P62310 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LSM3P62310 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LSM3P62310 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LSM3P62310 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LSM3P62310 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LSM3P62310 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LSM3P62310 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LSM3P62310 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LSM3P62310 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LSM3P62310 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LSM3P62310 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LSM3P62310 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LSM3P62310 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LSM3P62310 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LSM3P62310 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LSM3P62310 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LSM3P62310 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LSM3P62310 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
LSM3P62310 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LSM3P62310 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LSM3P62310 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LSM3P62310 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LSM3P62310 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LSM3P62310 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LSM3P62310 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LSM3P62310 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LSM3P62310 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LSM3P62310 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LSM3P62310 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
LSM3P62310 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LSM3P62310 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LSM3P62310 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LSM3P62310 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LSM3P62310 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LSM3P62310 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LSM3P62310 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LSM3P62310 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LSM3P62310 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LSM3P62310 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LSM3P62310 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LSM3P62310 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LSM3P62310 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LSM3P62310 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LSM3P62310 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LSM3P62310 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LSM3P62310 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LSM3P62310 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LSM3P62310 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LSM3P62310 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LSM3P62310 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LSM3P62310 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LSM3P62310 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LSM3P62310 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LSM3P62310 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LSM3P62310 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LSM3P62310 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LSM3P62310 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LSM3P62310 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LSM3P62310 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSM3P62310 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSM3P62310 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSM3P62310 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSM3P62310 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSM3P62310 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LSM3P62310 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSM3P62310 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSM3P62310 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LSM3P62310 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSM3P62310 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSM3P62310 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSM3P62310 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSM3P62310 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSM3P62310 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSM3P62310 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LSM3P62310 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LSM3P62310 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LSM3P62310 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LSM3P62310 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LSM3P62310 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LSM3P62310 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LSM3P62310 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LSM3P62310 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LSM3P62310 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LSM3P62310 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LSM3P62310 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LSM3P62310 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LSM3P62310 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LSM3P62310 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LSM3P62310 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSM3P62310 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSM3P62310 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSM3P62310 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSM3P62310 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LSM3P62310 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSM3P62310 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSM3P62310 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSM3P62310 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LSM3P62310 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LSM3P62310 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LSM3P62310 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms