Protein–RNA interactions for Protein: P62140

PPP1CB, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-beta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CBP62140 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPP1CBP62140 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPP1CBP62140 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPP1CBP62140 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPP1CBP62140 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPP1CBP62140 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPP1CBP62140 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPP1CBP62140 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPP1CBP62140 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPP1CBP62140 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPP1CBP62140 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPP1CBP62140 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPP1CBP62140 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPP1CBP62140 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPP1CBP62140 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPP1CBP62140 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPP1CBP62140 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPP1CBP62140 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPP1CBP62140 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PPP1CBP62140 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPP1CBP62140 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPP1CBP62140 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPP1CBP62140 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPP1CBP62140 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPP1CBP62140 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPP1CBP62140 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPP1CBP62140 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPP1CBP62140 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPP1CBP62140 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPP1CBP62140 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPP1CBP62140 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PPP1CBP62140 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPP1CBP62140 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPP1CBP62140 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPP1CBP62140 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPP1CBP62140 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPP1CBP62140 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPP1CBP62140 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPP1CBP62140 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPP1CBP62140 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPP1CBP62140 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPP1CBP62140 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPP1CBP62140 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPP1CBP62140 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPP1CBP62140 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPP1CBP62140 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPP1CBP62140 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPP1CBP62140 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPP1CBP62140 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPP1CBP62140 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPP1CBP62140 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPP1CBP62140 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPP1CBP62140 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPP1CBP62140 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPP1CBP62140 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPP1CBP62140 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPP1CBP62140 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPP1CBP62140 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPP1CBP62140 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPP1CBP62140 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPP1CBP62140 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPP1CBP62140 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPP1CBP62140 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPP1CBP62140 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPP1CBP62140 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPP1CBP62140 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPP1CBP62140 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPP1CBP62140 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPP1CBP62140 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPP1CBP62140 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPP1CBP62140 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPP1CBP62140 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPP1CBP62140 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPP1CBP62140 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPP1CBP62140 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPP1CBP62140 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPP1CBP62140 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPP1CBP62140 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PPP1CBP62140 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPP1CBP62140 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPP1CBP62140 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPP1CBP62140 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPP1CBP62140 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPP1CBP62140 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPP1CBP62140 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PPP1CBP62140 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPP1CBP62140 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPP1CBP62140 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPP1CBP62140 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPP1CBP62140 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPP1CBP62140 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPP1CBP62140 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPP1CBP62140 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPP1CBP62140 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPP1CBP62140 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPP1CBP62140 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPP1CBP62140 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPP1CBP62140 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPP1CBP62140 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPP1CBP62140 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms