Protein–RNA interactions for Protein: P61962

DCAF7, DDB1- and CUL4-associated factor 7, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF7P61962 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCAF7P61962 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCAF7P61962 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCAF7P61962 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCAF7P61962 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCAF7P61962 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCAF7P61962 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCAF7P61962 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCAF7P61962 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCAF7P61962 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCAF7P61962 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCAF7P61962 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCAF7P61962 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCAF7P61962 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DCAF7P61962 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCAF7P61962 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCAF7P61962 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCAF7P61962 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCAF7P61962 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCAF7P61962 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCAF7P61962 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCAF7P61962 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCAF7P61962 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCAF7P61962 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCAF7P61962 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCAF7P61962 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCAF7P61962 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCAF7P61962 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCAF7P61962 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCAF7P61962 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DCAF7P61962 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCAF7P61962 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCAF7P61962 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCAF7P61962 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCAF7P61962 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCAF7P61962 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCAF7P61962 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCAF7P61962 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCAF7P61962 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCAF7P61962 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCAF7P61962 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCAF7P61962 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCAF7P61962 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCAF7P61962 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCAF7P61962 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCAF7P61962 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCAF7P61962 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCAF7P61962 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCAF7P61962 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCAF7P61962 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCAF7P61962 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCAF7P61962 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCAF7P61962 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCAF7P61962 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCAF7P61962 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCAF7P61962 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCAF7P61962 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DCAF7P61962 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCAF7P61962 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCAF7P61962 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCAF7P61962 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DCAF7P61962 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCAF7P61962 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DCAF7P61962 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DCAF7P61962 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCAF7P61962 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCAF7P61962 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCAF7P61962 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCAF7P61962 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DCAF7P61962 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCAF7P61962 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF7P61962 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF7P61962 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF7P61962 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF7P61962 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF7P61962 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF7P61962 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF7P61962 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF7P61962 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCAF7P61962 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCAF7P61962 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCAF7P61962 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCAF7P61962 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCAF7P61962 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCAF7P61962 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCAF7P61962 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCAF7P61962 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCAF7P61962 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCAF7P61962 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCAF7P61962 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCAF7P61962 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCAF7P61962 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCAF7P61962 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF7P61962 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF7P61962 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF7P61962 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF7P61962 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF7P61962 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF7P61962 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
DCAF7P61962 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms