Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERVK-21P61565 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERVK-21P61565 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERVK-21P61565 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERVK-21P61565 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVK-21P61565 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVK-21P61565 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVK-21P61565 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVK-21P61565 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVK-21P61565 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVK-21P61565 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVK-21P61565 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVK-21P61565 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVK-21P61565 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVK-21P61565 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVK-21P61565 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVK-21P61565 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVK-21P61565 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVK-21P61565 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVK-21P61565 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVK-21P61565 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVK-21P61565 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVK-21P61565 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVK-21P61565 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVK-21P61565 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVK-21P61565 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVK-21P61565 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVK-21P61565 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVK-21P61565 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVK-21P61565 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVK-21P61565 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVK-21P61565 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVK-21P61565 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVK-21P61565 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVK-21P61565 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVK-21P61565 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVK-21P61565 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVK-21P61565 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVK-21P61565 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVK-21P61565 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVK-21P61565 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVK-21P61565 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVK-21P61565 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVK-21P61565 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVK-21P61565 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVK-21P61565 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVK-21P61565 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVK-21P61565 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVK-21P61565 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVK-21P61565 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVK-21P61565 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVK-21P61565 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVK-21P61565 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVK-21P61565 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVK-21P61565 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVK-21P61565 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVK-21P61565 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVK-21P61565 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVK-21P61565 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVK-21P61565 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVK-21P61565 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVK-21P61565 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVK-21P61565 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVK-21P61565 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVK-21P61565 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVK-21P61565 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVK-21P61565 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVK-21P61565 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVK-21P61565 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVK-21P61565 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVK-21P61565 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVK-21P61565 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVK-21P61565 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVK-21P61565 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVK-21P61565 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVK-21P61565 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVK-21P61565 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVK-21P61565 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVK-21P61565 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVK-21P61565 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVK-21P61565 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVK-21P61565 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVK-21P61565 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVK-21P61565 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVK-21P61565 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVK-21P61565 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVK-21P61565 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVK-21P61565 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVK-21P61565 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVK-21P61565 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVK-21P61565 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVK-21P61565 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVK-21P61565 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVK-21P61565 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVK-21P61565 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVK-21P61565 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVK-21P61565 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVK-21P61565 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVK-21P61565 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVK-21P61565 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms