Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARF3P61204 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARF3P61204 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARF3P61204 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARF3P61204 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARF3P61204 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARF3P61204 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARF3P61204 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARF3P61204 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARF3P61204 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARF3P61204 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARF3P61204 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARF3P61204 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARF3P61204 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ARF3P61204 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARF3P61204 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARF3P61204 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARF3P61204 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARF3P61204 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARF3P61204 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARF3P61204 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARF3P61204 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ARF3P61204 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARF3P61204 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARF3P61204 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ARF3P61204 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARF3P61204 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARF3P61204 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARF3P61204 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARF3P61204 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARF3P61204 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARF3P61204 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARF3P61204 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARF3P61204 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARF3P61204 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARF3P61204 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARF3P61204 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARF3P61204 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARF3P61204 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARF3P61204 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARF3P61204 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARF3P61204 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARF3P61204 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARF3P61204 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ARF3P61204 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARF3P61204 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARF3P61204 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARF3P61204 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARF3P61204 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARF3P61204 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ARF3P61204 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARF3P61204 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARF3P61204 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARF3P61204 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARF3P61204 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARF3P61204 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARF3P61204 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARF3P61204 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARF3P61204 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARF3P61204 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARF3P61204 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARF3P61204 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARF3P61204 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARF3P61204 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARF3P61204 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARF3P61204 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARF3P61204 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARF3P61204 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARF3P61204 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARF3P61204 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARF3P61204 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARF3P61204 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARF3P61204 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARF3P61204 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARF3P61204 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARF3P61204 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARF3P61204 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARF3P61204 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARF3P61204 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARF3P61204 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARF3P61204 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARF3P61204 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARF3P61204 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARF3P61204 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARF3P61204 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARF3P61204 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARF3P61204 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARF3P61204 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ARF3P61204 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARF3P61204 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ARF3P61204 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARF3P61204 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARF3P61204 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARF3P61204 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARF3P61204 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ARF3P61204 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARF3P61204 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARF3P61204 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARF3P61204 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARF3P61204 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms