Protein–RNA interactions for Protein: P60520

GABARAPL2, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL2P60520 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABARAPL2P60520 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABARAPL2P60520 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABARAPL2P60520 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABARAPL2P60520 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABARAPL2P60520 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABARAPL2P60520 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABARAPL2P60520 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABARAPL2P60520 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABARAPL2P60520 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABARAPL2P60520 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABARAPL2P60520 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABARAPL2P60520 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABARAPL2P60520 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABARAPL2P60520 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABARAPL2P60520 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABARAPL2P60520 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABARAPL2P60520 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABARAPL2P60520 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABARAPL2P60520 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABARAPL2P60520 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABARAPL2P60520 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABARAPL2P60520 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABARAPL2P60520 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABARAPL2P60520 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABARAPL2P60520 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABARAPL2P60520 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABARAPL2P60520 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GABARAPL2P60520 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABARAPL2P60520 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABARAPL2P60520 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABARAPL2P60520 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABARAPL2P60520 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABARAPL2P60520 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABARAPL2P60520 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABARAPL2P60520 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABARAPL2P60520 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABARAPL2P60520 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABARAPL2P60520 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABARAPL2P60520 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABARAPL2P60520 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABARAPL2P60520 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABARAPL2P60520 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GABARAPL2P60520 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABARAPL2P60520 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABARAPL2P60520 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABARAPL2P60520 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABARAPL2P60520 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABARAPL2P60520 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABARAPL2P60520 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABARAPL2P60520 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABARAPL2P60520 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABARAPL2P60520 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABARAPL2P60520 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABARAPL2P60520 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABARAPL2P60520 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABARAPL2P60520 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABARAPL2P60520 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABARAPL2P60520 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABARAPL2P60520 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABARAPL2P60520 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GABARAPL2P60520 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABARAPL2P60520 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABARAPL2P60520 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABARAPL2P60520 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABARAPL2P60520 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABARAPL2P60520 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABARAPL2P60520 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABARAPL2P60520 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABARAPL2P60520 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABARAPL2P60520 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABARAPL2P60520 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABARAPL2P60520 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABARAPL2P60520 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABARAPL2P60520 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABARAPL2P60520 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABARAPL2P60520 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABARAPL2P60520 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABARAPL2P60520 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABARAPL2P60520 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABARAPL2P60520 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABARAPL2P60520 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABARAPL2P60520 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GABARAPL2P60520 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABARAPL2P60520 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABARAPL2P60520 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABARAPL2P60520 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABARAPL2P60520 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABARAPL2P60520 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABARAPL2P60520 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABARAPL2P60520 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABARAPL2P60520 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABARAPL2P60520 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABARAPL2P60520 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABARAPL2P60520 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABARAPL2P60520 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABARAPL2P60520 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABARAPL2P60520 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABARAPL2P60520 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABARAPL2P60520 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms