Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LINC01547P58512 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LINC01547P58512 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LINC01547P58512 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LINC01547P58512 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LINC01547P58512 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LINC01547P58512 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
LINC01547P58512 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LINC01547P58512 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LINC01547P58512 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LINC01547P58512 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LINC01547P58512 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LINC01547P58512 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LINC01547P58512 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LINC01547P58512 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LINC01547P58512 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LINC01547P58512 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms