Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GSCP56915 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GSCP56915 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GSCP56915 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GSCP56915 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GSCP56915 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GSCP56915 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GSCP56915 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GSCP56915 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GSCP56915 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GSCP56915 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GSCP56915 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GSCP56915 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GSCP56915 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GSCP56915 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GSCP56915 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GSCP56915 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GSCP56915 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GSCP56915 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GSCP56915 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GSCP56915 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GSCP56915 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GSCP56915 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GSCP56915 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GSCP56915 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GSCP56915 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GSCP56915 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GSCP56915 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GSCP56915 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GSCP56915 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GSCP56915 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GSCP56915 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GSCP56915 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GSCP56915 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GSCP56915 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GSCP56915 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GSCP56915 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GSCP56915 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GSCP56915 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GSCP56915 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GSCP56915 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GSCP56915 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GSCP56915 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GSCP56915 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GSCP56915 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GSCP56915 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GSCP56915 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GSCP56915 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GSCP56915 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GSCP56915 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GSCP56915 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GSCP56915 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GSCP56915 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GSCP56915 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GSCP56915 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GSCP56915 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GSCP56915 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GSCP56915 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GSCP56915 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GSCP56915 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GSCP56915 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GSCP56915 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GSCP56915 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GSCP56915 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GSCP56915 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GSCP56915 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GSCP56915 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GSCP56915 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GSCP56915 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GSCP56915 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GSCP56915 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GSCP56915 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GSCP56915 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GSCP56915 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GSCP56915 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GSCP56915 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GSCP56915 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GSCP56915 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GSCP56915 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GSCP56915 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GSCP56915 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GSCP56915 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GSCP56915 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GSCP56915 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GSCP56915 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GSCP56915 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GSCP56915 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GSCP56915 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GSCP56915 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GSCP56915 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GSCP56915 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GSCP56915 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GSCP56915 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GSCP56915 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GSCP56915 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GSCP56915 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GSCP56915 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GSCP56915 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GSCP56915 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GSCP56915 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.2 ms