Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GFRA1P56159 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GFRA1P56159 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GFRA1P56159 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GFRA1P56159 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GFRA1P56159 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GFRA1P56159 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GFRA1P56159 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GFRA1P56159 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GFRA1P56159 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GFRA1P56159 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GFRA1P56159 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GFRA1P56159 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GFRA1P56159 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GFRA1P56159 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GFRA1P56159 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GFRA1P56159 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GFRA1P56159 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GFRA1P56159 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GFRA1P56159 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GFRA1P56159 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GFRA1P56159 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GFRA1P56159 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GFRA1P56159 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GFRA1P56159 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GFRA1P56159 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GFRA1P56159 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GFRA1P56159 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GFRA1P56159 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GFRA1P56159 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GFRA1P56159 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GFRA1P56159 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GFRA1P56159 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GFRA1P56159 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GFRA1P56159 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GFRA1P56159 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GFRA1P56159 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GFRA1P56159 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GFRA1P56159 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GFRA1P56159 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GFRA1P56159 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GFRA1P56159 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GFRA1P56159 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GFRA1P56159 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GFRA1P56159 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GFRA1P56159 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GFRA1P56159 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GFRA1P56159 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GFRA1P56159 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GFRA1P56159 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GFRA1P56159 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GFRA1P56159 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GFRA1P56159 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GFRA1P56159 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GFRA1P56159 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GFRA1P56159 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GFRA1P56159 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GFRA1P56159 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GFRA1P56159 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GFRA1P56159 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GFRA1P56159 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GFRA1P56159 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GFRA1P56159 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GFRA1P56159 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GFRA1P56159 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GFRA1P56159 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GFRA1P56159 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GFRA1P56159 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GFRA1P56159 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GFRA1P56159 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GFRA1P56159 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GFRA1P56159 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GFRA1P56159 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GFRA1P56159 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GFRA1P56159 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GFRA1P56159 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GFRA1P56159 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GFRA1P56159 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GFRA1P56159 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GFRA1P56159 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GFRA1P56159 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GFRA1P56159 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GFRA1P56159 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GFRA1P56159 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GFRA1P56159 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GFRA1P56159 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GFRA1P56159 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GFRA1P56159 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GFRA1P56159 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GFRA1P56159 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GFRA1P56159 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GFRA1P56159 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GFRA1P56159 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GFRA1P56159 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GFRA1P56159 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GFRA1P56159 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GFRA1P56159 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GFRA1P56159 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GFRA1P56159 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GFRA1P56159 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms