Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAX9P55771 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAX9P55771 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PAX9P55771 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAX9P55771 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAX9P55771 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAX9P55771 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAX9P55771 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAX9P55771 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAX9P55771 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAX9P55771 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAX9P55771 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAX9P55771 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAX9P55771 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAX9P55771 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAX9P55771 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAX9P55771 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAX9P55771 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAX9P55771 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAX9P55771 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAX9P55771 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAX9P55771 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAX9P55771 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAX9P55771 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAX9P55771 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAX9P55771 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PAX9P55771 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PAX9P55771 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAX9P55771 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAX9P55771 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAX9P55771 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAX9P55771 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAX9P55771 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAX9P55771 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAX9P55771 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAX9P55771 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAX9P55771 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAX9P55771 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAX9P55771 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAX9P55771 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAX9P55771 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAX9P55771 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAX9P55771 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAX9P55771 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PAX9P55771 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAX9P55771 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAX9P55771 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PAX9P55771 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PAX9P55771 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PAX9P55771 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PAX9P55771 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAX9P55771 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAX9P55771 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAX9P55771 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAX9P55771 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAX9P55771 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAX9P55771 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAX9P55771 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAX9P55771 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAX9P55771 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAX9P55771 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAX9P55771 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAX9P55771 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PAX9P55771 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAX9P55771 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAX9P55771 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAX9P55771 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PAX9P55771 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PAX9P55771 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAX9P55771 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAX9P55771 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAX9P55771 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAX9P55771 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAX9P55771 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAX9P55771 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAX9P55771 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAX9P55771 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAX9P55771 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAX9P55771 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAX9P55771 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAX9P55771 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAX9P55771 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAX9P55771 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAX9P55771 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAX9P55771 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAX9P55771 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAX9P55771 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAX9P55771 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAX9P55771 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAX9P55771 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PAX9P55771 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAX9P55771 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAX9P55771 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAX9P55771 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAX9P55771 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAX9P55771 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAX9P55771 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAX9P55771 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAX9P55771 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAX9P55771 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms