Protein–RNA interactions for Protein: P55344

LIM2, Lens fiber membrane intrinsic protein, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIM2P55344 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIM2P55344 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIM2P55344 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIM2P55344 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIM2P55344 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIM2P55344 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LIM2P55344 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIM2P55344 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIM2P55344 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIM2P55344 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIM2P55344 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIM2P55344 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIM2P55344 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIM2P55344 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIM2P55344 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LIM2P55344 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LIM2P55344 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIM2P55344 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIM2P55344 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIM2P55344 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIM2P55344 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIM2P55344 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIM2P55344 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIM2P55344 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIM2P55344 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIM2P55344 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIM2P55344 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIM2P55344 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIM2P55344 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIM2P55344 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIM2P55344 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIM2P55344 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LIM2P55344 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIM2P55344 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIM2P55344 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIM2P55344 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIM2P55344 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIM2P55344 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIM2P55344 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIM2P55344 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIM2P55344 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIM2P55344 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIM2P55344 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIM2P55344 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIM2P55344 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LIM2P55344 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIM2P55344 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIM2P55344 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIM2P55344 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIM2P55344 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIM2P55344 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIM2P55344 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIM2P55344 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIM2P55344 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIM2P55344 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIM2P55344 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIM2P55344 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIM2P55344 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIM2P55344 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIM2P55344 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIM2P55344 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIM2P55344 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIM2P55344 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIM2P55344 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIM2P55344 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIM2P55344 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIM2P55344 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIM2P55344 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIM2P55344 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIM2P55344 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIM2P55344 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIM2P55344 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIM2P55344 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIM2P55344 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIM2P55344 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIM2P55344 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIM2P55344 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIM2P55344 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIM2P55344 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIM2P55344 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIM2P55344 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIM2P55344 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIM2P55344 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIM2P55344 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIM2P55344 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIM2P55344 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIM2P55344 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIM2P55344 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIM2P55344 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIM2P55344 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIM2P55344 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIM2P55344 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIM2P55344 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIM2P55344 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIM2P55344 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LIM2P55344 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIM2P55344 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIM2P55344 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIM2P55344 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIM2P55344 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms