Protein–RNA interactions for Protein: P55291

CDH15, Cadherin-15, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH15P55291 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH15P55291 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH15P55291 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH15P55291 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH15P55291 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH15P55291 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH15P55291 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH15P55291 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH15P55291 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH15P55291 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH15P55291 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH15P55291 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH15P55291 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH15P55291 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH15P55291 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH15P55291 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH15P55291 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH15P55291 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH15P55291 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH15P55291 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH15P55291 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH15P55291 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH15P55291 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH15P55291 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH15P55291 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH15P55291 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH15P55291 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH15P55291 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH15P55291 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH15P55291 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH15P55291 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH15P55291 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH15P55291 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH15P55291 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH15P55291 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH15P55291 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH15P55291 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH15P55291 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH15P55291 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH15P55291 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH15P55291 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH15P55291 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH15P55291 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH15P55291 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH15P55291 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH15P55291 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH15P55291 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH15P55291 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH15P55291 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH15P55291 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH15P55291 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH15P55291 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH15P55291 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH15P55291 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH15P55291 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH15P55291 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDH15P55291 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDH15P55291 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CDH15P55291 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDH15P55291 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDH15P55291 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH15P55291 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH15P55291 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH15P55291 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH15P55291 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH15P55291 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH15P55291 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH15P55291 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH15P55291 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH15P55291 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH15P55291 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH15P55291 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH15P55291 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH15P55291 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH15P55291 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH15P55291 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH15P55291 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH15P55291 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDH15P55291 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDH15P55291 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDH15P55291 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDH15P55291 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDH15P55291 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDH15P55291 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDH15P55291 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDH15P55291 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDH15P55291 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDH15P55291 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDH15P55291 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDH15P55291 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDH15P55291 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDH15P55291 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDH15P55291 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CDH15P55291 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH15P55291 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH15P55291 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH15P55291 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH15P55291 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH15P55291 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH15P55291 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms