Protein–RNA interactions for Protein: P55209

NAP1L1, Nucleosome assembly protein 1-like 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L1P55209 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NAP1L1P55209 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NAP1L1P55209 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NAP1L1P55209 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NAP1L1P55209 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NAP1L1P55209 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NAP1L1P55209 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NAP1L1P55209 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NAP1L1P55209 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NAP1L1P55209 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NAP1L1P55209 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NAP1L1P55209 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NAP1L1P55209 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NAP1L1P55209 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NAP1L1P55209 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NAP1L1P55209 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NAP1L1P55209 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NAP1L1P55209 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NAP1L1P55209 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NAP1L1P55209 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NAP1L1P55209 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NAP1L1P55209 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NAP1L1P55209 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NAP1L1P55209 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NAP1L1P55209 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NAP1L1P55209 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NAP1L1P55209 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NAP1L1P55209 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NAP1L1P55209 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NAP1L1P55209 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NAP1L1P55209 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NAP1L1P55209 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NAP1L1P55209 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NAP1L1P55209 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NAP1L1P55209 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NAP1L1P55209 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NAP1L1P55209 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NAP1L1P55209 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NAP1L1P55209 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NAP1L1P55209 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NAP1L1P55209 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NAP1L1P55209 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NAP1L1P55209 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NAP1L1P55209 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NAP1L1P55209 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NAP1L1P55209 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NAP1L1P55209 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NAP1L1P55209 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NAP1L1P55209 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NAP1L1P55209 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NAP1L1P55209 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NAP1L1P55209 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NAP1L1P55209 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NAP1L1P55209 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NAP1L1P55209 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NAP1L1P55209 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NAP1L1P55209 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NAP1L1P55209 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NAP1L1P55209 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NAP1L1P55209 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NAP1L1P55209 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NAP1L1P55209 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NAP1L1P55209 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NAP1L1P55209 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NAP1L1P55209 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NAP1L1P55209 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NAP1L1P55209 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NAP1L1P55209 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NAP1L1P55209 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NAP1L1P55209 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NAP1L1P55209 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NAP1L1P55209 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NAP1L1P55209 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NAP1L1P55209 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NAP1L1P55209 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NAP1L1P55209 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NAP1L1P55209 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NAP1L1P55209 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NAP1L1P55209 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NAP1L1P55209 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NAP1L1P55209 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NAP1L1P55209 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NAP1L1P55209 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NAP1L1P55209 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NAP1L1P55209 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NAP1L1P55209 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NAP1L1P55209 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NAP1L1P55209 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NAP1L1P55209 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NAP1L1P55209 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NAP1L1P55209 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NAP1L1P55209 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NAP1L1P55209 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NAP1L1P55209 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NAP1L1P55209 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NAP1L1P55209 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NAP1L1P55209 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NAP1L1P55209 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NAP1L1P55209 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NAP1L1P55209 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms