Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HIRAP54198 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HIRAP54198 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HIRAP54198 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HIRAP54198 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HIRAP54198 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HIRAP54198 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HIRAP54198 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HIRAP54198 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HIRAP54198 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HIRAP54198 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
HIRAP54198 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HIRAP54198 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
HIRAP54198 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HIRAP54198 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HIRAP54198 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HIRAP54198 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HIRAP54198 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HIRAP54198 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HIRAP54198 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HIRAP54198 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HIRAP54198 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HIRAP54198 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HIRAP54198 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HIRAP54198 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HIRAP54198 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HIRAP54198 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HIRAP54198 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HIRAP54198 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HIRAP54198 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
HIRAP54198 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HIRAP54198 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HIRAP54198 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HIRAP54198 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HIRAP54198 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HIRAP54198 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HIRAP54198 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HIRAP54198 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HIRAP54198 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HIRAP54198 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HIRAP54198 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
HIRAP54198 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HIRAP54198 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HIRAP54198 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HIRAP54198 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HIRAP54198 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HIRAP54198 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HIRAP54198 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HIRAP54198 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HIRAP54198 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HIRAP54198 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
HIRAP54198 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HIRAP54198 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HIRAP54198 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HIRAP54198 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HIRAP54198 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HIRAP54198 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
HIRAP54198 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HIRAP54198 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HIRAP54198 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HIRAP54198 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HIRAP54198 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HIRAP54198 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
HIRAP54198 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HIRAP54198 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
HIRAP54198 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HIRAP54198 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HIRAP54198 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HIRAP54198 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HIRAP54198 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
HIRAP54198 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HIRAP54198 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HIRAP54198 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HIRAP54198 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HIRAP54198 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
HIRAP54198 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HIRAP54198 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HIRAP54198 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HIRAP54198 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HIRAP54198 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HIRAP54198 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HIRAP54198 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HIRAP54198 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HIRAP54198 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HIRAP54198 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HIRAP54198 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HIRAP54198 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HIRAP54198 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HIRAP54198 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HIRAP54198 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HIRAP54198 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
HIRAP54198 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HIRAP54198 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HIRAP54198 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HIRAP54198 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HIRAP54198 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HIRAP54198 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HIRAP54198 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
HIRAP54198 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HIRAP54198 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms